奇怪的是，大流感死者以20歲~35歲年輕人居多，而不是一般認為免疫力低下的幼兒或老人，這起謎團直到近代才解開，科學家從當時的死者遺體身上找到病毒，確認為H1N1 A型流感病毒（與2009年「豬流感」相同），這種病毒會在患者體內引發細胞因子風暴（Cytokine storm），導致免疫系統過度反應，因此本該是免疫力最強的青壯年，反而容易因強烈反應而死。
各國政府起初為了避免分散戰力，不願對疫情強加宣導，但病毒很快席捲各大軍營，用來照顧受傷官兵的醫護帳篷內，躺的幾乎都是感冒病患，加上死者多為青壯年，造成各國沒有兵源可以補充，成為提早結束大戰的原因之一。
「西班牙流感」來得快去得也快，社會大眾一直不知道疫病原因。1933年，英國科學家找出第一個人類流感病毒並命名為H1N1，從此人們才知道流行性感冒是流感病毒所造成，但由於這場流感的多數遺體已經下葬或燒毀，無從確認病毒種類。
1998年2月，美國國防病理中心（AFIP）在阿拉斯加的布瑞維格米申（Brevig Mission）發現一具被完整冰封近80年的愛斯基摩女子遺體，這個村莊當年因為流感失去了85%的人口。科學家從這具遺體中找到了1918病毒的基因，才為謎團添加了更多可信證據和答案。
美國疾病管制局（CDC）指出，過了100年，今日醫學已經進步到可以複製動物或移植各種器官，但對流感病毒的控制能力仍然不夠理想，以近日流傳的流感為例，只有30%的疫苗能夠發揮作用，成功幫助免疫系統辨識病毒。
「很顯然，我們還是無法控制病毒，」美國歷史學者、《大流感》（The Great Influenza）作者貝瑞（John M. Barry）表示：「很多層面上來說，我們跟1918年一樣脆弱，甚至比以前更脆弱，因為現今的全球經濟互相依賴程度更高。」
疾管局副局長索辛（Daniel Sosin）也說，「我們當然有了更好的應變能力，可以有效應付相同類型的病毒，但另一方面，我們也可能面臨傳播更快速、症狀更嚴重的流感。」
