台灣行政院則表示，將邀請台灣漁業署和原子能委員會評估，日本含氚廢水排入海，若有科學數據顯示影響台灣漁業，一定會向日本政府求償。
謝長廷的一番發言，讓此議題上升到外交層次。譬如，一貫持本土立場，主張台灣親美友日的台媒《台北時報》（Taipei Times），甚至在上周末（5月2日）於社論批評謝長廷作為外交官，就相關重大議題發言不夠小心。該社論稱，曾擔任台灣行政院長及高雄市長的謝長廷擔任駐日代表已經超過五年，他在民進黨內的影響力仍大。
福島核廢水安全嗎？
2011年3月，日本東北大地震及引發的海嘯，導致福島的第一核電站嚴重受損，產生的核廢水儲存至今。
截至2021年3月，核廢水總量已達125萬噸，足以填滿約500個標準游泳池。
此次爭議主要是廢水當中的氚物質含量。
氚是一種氫的放射性同位素，一般存在於核反應之後。當時福島核電站事故，產生了被高濃度放射性物質污染的水，儘管經過淨化和稀釋，但廢水中仍含有氚，批評者擔憂這將影響海洋環境。
日本首相菅義偉4月13日稱，處置廢水「是無法避開的課題」。
東京當局強調將加以處理、稀釋，使其核輻射水平低於飲用水。聯合國國際原子能機構（IAEA）更形容是報廢福島第一核電站工作的一個「里程碑」; 總幹事格羅西（Rafael Mariano Grossi）更公開歡迎東京政府的決定，並說IAEA已預備隨時支援日本處理福島核廢水。
但日本民間以至於國際環境團體均提出抗議，漁業尤其擔心排放廢水將重創其生計。
曾在日本研究福島核災多年的彭保羅（Paul Jobin）向BBC分析，日本政府雖然冀望降低反對者聲音，並宣稱擔憂來自所謂的「謠言」或「誤解」。但鑒於當前的核廢水處理技術存在著嚴重的科學不確定性（譬如如何稀釋掉鈷60，碳14，氚和其他放射性物質），「我們有充分的理由擔心海洋可能受到污染。 」
「經過多年努力重振福島，此次排放廢水決定對整個日本漁業來說確實是災難性的。 這意味著福島及其鄰省的人民再一次被政策犧牲。」彭保羅說。
國際環保組織「綠色和平」（Green Peace）也強烈抨擊日本決定，他們稱福島核廢水內的放射物不僅只有氚，甚至有更多放射物質，影響海洋安全及人體健康，「而且種類更多」。該組織又稱，福島核事故產生的核廢水已超過125萬公噸，而其中77.8萬公噸（約為63%），尚未經過國際核廢水處理標準（ALPS）第二階段廢水處理，也沒有明確的進程時間表保證第二階段能夠順利進行。
