農委會15日公布資料，全台未在農田水利會灌區內的農地面積，高達37萬公頃，比水利會灌區所涵蓋的31萬公頃還要大，農委會副主委陳吉仲表示，農委會長期以來沒有足夠編列農田水利預算，導致全台有10萬公頃土地廢耕，水利會改制為公法人後，農委會將爭取前瞻基礎建設預算，增加全台水利會灌溉面積，有助於農業永續發展。
行政院院會上周通過《農田水利會組織通則》後，相關反對意見陸續湧現，不僅馬政府時代農委會主委陳保基，批評該項政策可能損害台灣農業，前台南縣長蘇煥智也批評，全台水利會會長改官派，可能有違憲之虞。
「水利會所有推動工程，都必須依據《政府採購法》」
對於外界批評，陳吉仲表示，農委會一直到今天，都不願去談農田水利會會長選舉過程負面議題，但為了釐清事實真相，「農委會可以把150萬個水利會會員與農民關係，以及過去4次選舉結果進行總盤點。」
「農委會過去以來，不斷收到水利會員工寄給我們的各種檢舉信函，包括會務運作、灌溉工程發包可能衍生問題」，陳吉仲說，未來改制公法人後，水利會推動所有工程，都必須依據《政府採購法》推動，可以大幅提高會務運作透明度。
「改制後強化水利設施投資，目前非灌區農地可少抽地下水」
陳吉仲表示，農委會日前完成全台農地盤點，盤點結果顯示，目前台灣長期廢耕農地高達10.5萬公頃，全台水利會目前僅能提供31萬公頃農地灌溉，在灌溉區外的37萬公頃，係透過抽取地下水等方式取得農業用水，未來如果能夠透過改制，強化農田水利設施的投資，目前非灌區的農地就可以少抽地下水，「對台灣農業永續經營，是好是壞？」
陳吉仲坦言，農委會過去長期沒有足夠編列農田水利預算，是間接導致部分農地廢耕的原因之一，針對水利會改制問題，農委會願意與不同意見專家學者坐下來溝通，未來改制為公法人後，農委會也會在前瞻特別預算中，爭取農田水利建設預算，把目前台南地區推動大糧倉計畫用水不足問題，以及花蓮玉里先前颱風淹水，部分農地水利設施不足問題予以改善。
