麥克維最後被判定負有「不可推卸的責任」，是二戰美軍損失380艘戰艦中唯一被送上軍事法庭的艦長，他被降級、調職，最後於1949年退役。然而悲痛的官兵家屬仍認定麥克維瀆職，經常寄信咒罵、譴責麥克維害死了他們的兒子。1968年11月6日，已高齡70歲、但不堪長期精神壓力的麥克維，在自家院子以軍用手槍自盡，據說他的左手還握著一只水兵玩偶。
12歲男孩挖掘資料 還艦長清白
麥克維死後，300餘名倖存官兵堅信艦長是無辜的，組成救濟會替麥克維伸冤卻始終不被理睬。豈知1997年時，一名12歲中學生史考特（Henry Scott）看了電影《大白鯊》後對這段歷史產生興趣，在老師鼓勵下，史考特訪問近150名生還官兵、研究近千份檔案，得出麥克維是清白的證據，並把報告送往國會，引發全國轟動。
國會重啟調查後發現，造於二戰之前的印地安納波利斯號沒有潛艦探測裝備，麥克維曾因此要求驅逐艦護送，但上級告訴麥克維，路線上沒有敵人潛艦的威脅而拒絕他的要求，卻沒有告知麥克維，該海域於7月24日才剛剛有一艘驅逐艦被日軍擊沉。此外，有3個不同機構都曾收到印第安納波利斯號發出的SOS信號，卻認為是日軍的假信號而沒有理睬，錯過黃金救援時間。
最可惡的是，被帶往軍事法庭作證的橋本以行其實曾極力為麥克維澄清，橋本告訴美軍「即使以之字形前進也躲不過攻擊」，但是他的證詞卻被遭人竄改，以致辯護無效。
2000年，美國總統柯林頓（Bill Clinton）和國會終於正式宣布，麥克維在沉船事件中毫無過失，還給這位艦長一世清白，同年也掀起了搜索熱潮，不少民間尋寶組織開始搜索印第安納波利斯號。2016年好萊塢電影《USSI：勇者無畏》（USS Indianapolis: Men of Courage），由影帝尼可拉斯凱吉（Nicolas Cage）飾演艦長麥克維，讓麥克維和艦上官兵的英勇故事重新躍上世人眼前。
海軍歷史與遺跡檔案館（Naval History and Heritage Command）館長考克斯（Sam Cox）說：「印第安納波利斯號教會我們的寶貴一課，值得被好好留存、傳頌後世，以求不再犯下同樣錯誤，並拯救更多性命。」
據CNN報導，印第安納波利斯號當年倖存的官兵，如今還有22人在世，每一位都高齡逾90歲。
