禍不單行，中國雖然迫不及待找回疫情之前的生產動能，但南方長江流域進入汛期，自6月以來造成嚴重洪災，受影響人數逾1200萬人，超過9300間房屋倒塌，財產損失至少1060億台幣，更有近百萬公頃農作物受害。
新加坡管理大學（Singapore Management University）助理教授唐納森（John Donaldson）指出，新冠肺炎就像一場「完美風暴」，在同意時間衝擊中國社會的各個層面。「工廠還無法全力運轉……建設工地也停擺……會採購大量農作物的飯店也經營慘澹，」唐納森說。無可避免地，中國扶貧計劃也因政府全力投入防疫行動而被打亂。
儘管如此，中共當局並未忘記脫貧目標，不斷向國內民眾保證將會如期達標。6月初，習近平還親自前往寧夏，參觀接受「扶貧」基金而建立的棉花工廠並拜訪村民，全都經由官媒新華社大力放送宣傳。
無論情況如何，中國政府都不太可能在2020年底宣布脫貧計劃沒有達標，若目標無法達成，中國政府可能不惜造假數據來宣稱成功。更值得關注的是，即使真的讓全數國民脫離極度貧困，中國仍有非常多人民還活在糟糕的生活環境下，唐納森擔憂，一但北京宣布脫貧計劃成功，地方政府的扶貧力道也會鬆弛，不再費心關注數千萬、數百萬的貧窮人口。
