在慕尼黑，他談到了更快捷的疫苗製造方法。其中一個想法是利用現有成分來製造針對新病毒的訂製疫苗以節省時間。
當時，蓋茲基金會承諾向捐助方和政府聯盟提供1億美元，為對抗新發感染的新疫苗提供資金。這類疫苗的開發成本很高，且由於需求零星，基本無利可圖。目前，流行病預防創新聯盟（Coalition for Epidemic Preparedness Innovations）正在資助包括新冠疫苗在內的疫苗開發。
蓋茲充分利用他能接觸到政府領導人的能力，他認為政府是唯一有能力做好準備的實體。
「當我與歐洲、美國和世界各地的高層人士會面時，我選擇和他們談論這種大流行病風險。」他說。
他將慈善事業視為催化劑。「我把基金會數億美元的資金投入到這件事上。」他說，「但這實際上是政府的事情，就像國防預算是為了應對戰爭的爆發而存在的。」
世界各國許多領導人原則上同意他的看法。但由於缺乏直接的威脅，大多數國家不願花費大量資金來抵禦疾速發展的大流行病。「我希望我和其他人發出的警告，能促使全球採取更加協調一致的行動。」他說。
由於對外國政府缺乏行動感到沮喪，蓋茲轉向了國內的一個計劃。他想知道如何最好地減緩可能導致大流行病的呼吸道病毒傳播。
「每當我問到關於呼吸道病毒的問題，比如學校有多重要，如果你真實施隔離能減少多少傳播，甚至……口罩到底有沒有用？」他說，並沒有明確的答案。
為了弄清這些問題，他自掏腰包，斥資2000多萬美元投資一項從2018年開始的研究。該研究旨在尋找更好的方法來檢測流感，利用遺傳學追蹤感染，並阻止其傳播。研究人員開始對西雅圖地區的人群進行流感樣本測試。
1月中旬，病毒的首發地武漢封城時，蓋茲向其基金會的科學家提出一連串問題：哪些藥物最有希望？我們還要多久才能研製出疫苗？基金會如何能幫助加速試驗？
基金會開始承諾提供資金，啟動新病毒的治療和疫苗的開發。
2月中旬，蓋茲主持召開了一次流行病學家和全球健康專家的會議。據知情人士透露，聽取專家意見後，他告訴手下高級員工，中國控制新冠病毒的可能性也許還不到25% 。
當蓋茲看到病毒向更多國家蔓延後，他向基金會科學家以及製藥公司負責人詢問了測試能力、疫苗計劃以及基金會可以提供幫助的方式。
2月底時，西雅圖地區流感研究人員已處於流感研究的第二個年頭，他們發現一名青少年的測試樣本中有新冠病毒。遺傳分析顯示，這個樣本可能與該地區的一個早期病例有關。位於西雅圖的福瑞德哈金森腫瘤研究中心（Fred Hutchinson Cancer Research Center）的基因組流行病學家貝德福德（Trevor Bedford）說，這表明「有相當數量的社區傳播」。
