台大生物產業機電工程學系退休教授謝志誠問：「如果你是業者，會選一公斤450元的台灣茶、還是90元的中國茶進來做茶包？」他認為這項開放將導致更多農產品進口，尤其是距離較近、農產品相對替代性高的中國農產品。而不論未來生產的加工品內銷或外銷，都會對本地農產品造成衝擊。
關於這一點陳保基表示，未來進駐自經區的廠商會有審查機制，會影響到國內農產品的、或是會用到830項中國管制性農產品的將限制進駐條件。不過這個所謂「審查機制」還在研究階段，只是口頭承諾，如何解除人民的疑慮？
三、大陸農產品加工品掛MIT，如何維護MIT品牌？
條例草案第41條則排除進入自經區的產品不必檢驗，陳吉仲認為這將影響台灣農產品的安全、進而毀壞MIT品牌。他舉例，兩岸所訂的農藥殘留標準不同，台灣已核准登記使用的農藥、且訂有殘留標準的共657項，中國只有161項。衛福部、農委會一年花多少人力及經費在做中國農產品檢驗，都檢驗不了，未來進入自經區的產品連檢驗都免了，如何保障加工品安全？
對此農委會說：「農產品檢驗檢疫事項為重要國家安全事項，農委會必當嚴守關卡…自然不會影響MIT品質形象。」如此避重就輕的回答方式更令人反感。
綜上，學者提出的明確建議是，刪除第41、42條。第38條則排除農產品。而如果農委會念茲在茲的是台灣農業的未來，就請不要再說「利大於弊」，請針對以上學者質疑做一次完整評估，重新修正條例再送審，如此才能展現公民參與的誠意。何況事關台灣農業的未來，多一點時間討論才能趨吉避凶。
＊作者為獨立記者
