前中研院院長李遠哲在去年底出版的自傳《李遠哲傳》透露，2000年總統大選時他支持民進黨候選人陳水扁，在他要表態的前夕，他受到支持蕭萬長（與國民黨候選人連戰搭擋參選）的人士威脅，說要「殺光全家」，李遠哲25日接受電視訪問時指出，這名人士就是現任海基會董事長田弘茂。
田弘茂第一時間對李的說法「沒有評論」，他27日發表聲明指出，當時「絕無言語恐嚇」，一定有什麼誤會與誤解才讓李遠哲有這樣的感覺與感受，他個人對此覺得很遺憾，也願意在農曆春節返國後向李遠哲說明。
他指出，這是將近20年前的事情，但他記得很清楚，絕無出言恐嚇，「我們是鄰居，也是朋友」，他願在適當時機「當面向李院長說明與溝通」，希望能化解當年的誤會與不愉快，此事也引起各界關注，如有需要，他也會向媒體說明。
