民進黨力推《反滲透法》，總統蔡英文日前公開表示，要在年底前力拚《反滲透法》過關，此舉引發國民黨強烈不滿。針對該法案通過，對於兩岸宗教交流的影響，台灣世界保生大帝廟宇聯合總會總會長王文宗也提出質疑。王文宗表示，宗教是自由的，更反問「蔡英文選舉拜廟，哪尊神明不是大陸的？」
民進黨致力推動的《反滲透法》盼能在31日的本屆立院最後一個院會通過，立法院長蘇嘉全更為此於27日召集朝野協商，但至今仍暫無共識。
而針對《反滲透法》通過，是否將對宗教交流產生衝擊，也引發熱議。親民黨總統候選人宋楚瑜陣營發言人于美人日前就曾呼籲應擱置該法案，質問「媽祖是共諜嗎？玄天上帝是共諜嗎？」更為此和蔡英文隔空交鋒；另外國民黨總統候選人韓國瑜在27日也表示，《反滲透法》影響所及，將來媽祖、關公、保生大帝，連宗教交流都可能入罪，「台灣人情何以堪？」
對於法案是否將影響兩岸宗教團體交流，同時也是財團法人學甲慈濟宮董事長的王文宗表示，信衆每年都會組團到大陸謁祖參香，這是很正常的事情，他質問民進黨政府，「難道神明也是匪諜嗎？」呼籲應尊重民意懸崖勒馬。
根據《聯合報》報導，王文宗28日受訪時也說，《反滲透法》對人民來說是很大的恐嚇，如果通過，只要和對岸交流，政府就可以把你拘提到案，隨時亂扣帽子。王文宗也進一步表示，明明有《國安法》，為什麼還要增設《反滲透法》？他指出大選將至，現在就要修法了非常不合理，質疑是否有選舉操作之嫌？ （相關報導： 「反滲透法內容才是地雷」 柯文哲：不要跨年辦完，變成我是第一個適用的 ｜ 更多文章 ）
王文宗更指出，蔡英文拚選舉也會到處拜廟，神明都來自大陸，「難道也會選擇哪家是親中哪家愛台嗎？那蔡總統就應該告訴大家哪些廟是中國的，哪些是台灣的，不然人民會無所適從。」
