10月1日是中國國慶，而當天早上，香港中文大學、香港大學、樹仁大學、浸會大學、科技大學、城市大學、嶺南大學、香港教育大學、香港藝術學院等多間大專院校都出現高掛的「香港獨立」紅底白字旗幟，以推動香港獨立為主張的香港民族黨（Hong Kong National Party）表示是他們提供旗幟給各校學生，相關旗幟皆已被校方迅速拆除。
香港理工大學校方表示，校園設有可掛旗幟的地點，但校方未收到相關申請，而基於安全理由，，「香港獨立」的相關旗幟現已拆除。
多間大學及調景嶺現「香港獨立」直幡 https://t.co/OWm1KwahR3
— 港 獨 (@sabaocean) 2016年10月1日
樹仁大學在上午報警，而警方到場前，學校教職員已先行移除該旗幟。香港教育大學校方表示，1日凌晨發現相關旗幟，經查證後未找到物主，根據校規，校方可拆除任何未經申請的旗幟，校方也在早上11點多依照程序拆除旗幟。
城市大學校方表示，事前未收到懸掛旗幟的申請，出於安全理由，目前已移除了旗幟。嶺南大學校方表示，早上9點多發現校園高掛著相關旗幟，由於事前未收到申請，而且該旗幟可能危害全校師生，故已將旗幟移除。
多間大學及院校的校園內，今早有人掛上大幅同款紅底白色寫有「香港獨立」、「HONG KONG INDEPENDENCE」的字句標語。☞多間大專院校現「香港獨立」直幡 立場新聞 https://t.co/fr9Z8sB6AW pic.twitter.com/lgu24emmwJ
— Chou Hui-Chi (@SumiKeiKi) 2016年10月1日
香港民族黨表示，大學生主動聯絡他們，該黨也樂意給予旗幟。香港在9月初舉行立法會選舉，本土派新血進入國會，泛民主派連同本土派奪得19席，保有1/3的議席，對重大議案擁有否決權，證明港人追求民主的決心。
