除了九一一事件，KS穆罕默德也涉入多項重大恐怖攻擊案，包含資助了1993年世貿大樓停車場汽車爆炸案，造成6人死亡；2002年《華爾街日報》記者珀爾（Daniel Pearl）在巴基斯坦遭綁架殺害，KS穆罕默德聲稱自己正是親自將他斬首的劊子手；以及2003年雅加達萬豪酒店（JW Mariott）汽車爆炸案等等，他宣稱涉入的恐怖攻擊案至少31件，地點遍布全球。
關塔那摩灣虐囚醜聞重創美國形象
九一一事件之後，時任總統小布希（George W. Bush）在關塔那摩灣海軍基地設置軍事監獄，超過800名、來自87個國家的嫌疑犯曾被關押在此，被懷疑涉入恐怖攻擊案。但不久之後，無罪釋放的前囚犯與媒體紛紛踢爆，美軍在營內不斷對囚犯刑求、性虐待、強行注射藥品等暴行，造成未經定罪的囚犯自殺或絕食抗議，引發極大醜聞。
前總統歐巴馬（Barack Obama）曾在2009年1月21日簽署行政命令，宣布一年內關閉關塔那摩灣監獄，但遭到國會反對，監獄於是運作至今。
NPR指出，至今仍有40名囚犯關押在關達那摩灣，自總統川普（Donald Trump）上任後，只有一位被判無罪釋放，但也不再有人被關押進去。今年6月，一名被關押17年的葉門籍嫌犯請求審理他的案件，但遭到美國法院拒絕。
