首先是國會圖書館。該館收藏一批日治時期圖書資料，其由來據說是在占領時期（1945-1951）美軍從臺灣搬回美國，最初存放在華盛頓文件中心（Washington Document Center），後來這些資料分藏於NARA與國會圖書館，該中心也隨即解散。國會圖書館日文資料主要分成幾部分：一是臺灣總督府相關圖書資料；二是日本舊陸海軍相關資料；三是滿洲資料，以南滿鐵道株式會社資料為主。另外，還有日治時期的臺灣地圖。據說1990年代，臺灣曾要求美國當局歸還總督府資料，不過並沒有進一步下文。1992年日本學者發現其存在，從1994年開始進行全面性整理的計畫，直到1996年計畫結束為止，而後由田甫桂三、本多泰洋出版《舊臺灣總督府關係資料目錄》，並複製資料一份帶回日本。另外，又有田中宏己學者整理陸海軍資料，出版《占領接收舊陸海軍資料總目錄》，這些原始資料大部分都歸還了日本。
美國國家檔案館成立於1930年代，1935年正式運作，主要的使命是收藏保存美國政府各級機關的重要檔案，提供公眾使用。原設於華盛頓特區，但1960年代以後，因空間不足，而有增設新館之議，1993年馬里蘭州的二館落成，戰後檔案大都移至此地保存，其所典藏的檔案約占美國政府解密資料的1％到3％，均極具重要性，值得永久保存的文件。馬里蘭州的二館是六層樓的建築物，典藏文件總數約為200萬立方英尺，保存了大量與臺灣相關的檔案。
NARA對於檔案的編目層級方式是以檔案出處為主，主要分為三層。首先是聯邦政府之機關或委員會等，如國務省、陸軍省、國安會議等等，作為分類的第一層，稱為RG（Record Group），目前共有515個RG資料群。若以目前臺灣檔案管理局的編目概念來比擬，RG（Record Group），類似於「全宗」。
RG之下層則為Entry，它相當於政府機關下的處室（Division, Office），類似於臺灣檔案局編目「全宗」下層之「分類號」。Entry下層為Series，這相當於處室下之分部門（Provenance）或單位機構（Agency），為公文產生單位。然後以「盒子」（Box）作為Series層中的編號，保存各部門或單位機構的公文書。這類似臺灣檔案局「分類號」下層的「案次號」。最後在盒子內以資料夾（Folder）保存內容相關聯的「文件」。這些「文件」可能是該機關的「發文稿（留底）」或「收文」。因此在不同的資料群中，可能見到同樣內容的文件。
