一般而言，黴菌跟花粉一樣，沒有有效的迴避方式，只能盡可能減少暴露於其中的機會。以室外來說，落葉、肥料、乾草堆、家畜用牧草、釀造廠等處是主要會暴露於其中的場所；以室內來說，布沙發、純棉床墊、家具、壁紙、地毯、水槽、浴簾等處是主要會暴露於其中的場所。
針對室外黴菌，並無特別的處置措施，不過可以戴防護口罩降低暴露的風險；針對室內黴菌，則能經常打掃、保持乾燥並盡量除霉。
2.過敏性支氣管肺麴菌病
過敏性支氣管肺麴菌病（allergic bronchopulmonary aspergillosis，簡稱ABPA）是著名的黴菌所引起的過敏反應，此疾病由麴菌屬的麴菌所引起。麴菌會使因氣喘而免疫功能變差的人感染疾病，屬於會引起各種疾病如侵略全身的過敏性支氣管肺麴菌病的黴菌。
這種黴菌常存在於大自然、室內或室外等任何場所，尤其是肥料堆、樹穴蓋板、花盆的泥土、下水道設施、鳥類排泄物等處。
令人喘不過氣的氣喘是典型症狀，同時也會導致血液中的嗜酸性白血球增加，以及在胸部放射線檢查中一再出現肺浸潤的現象，一旦症狀持續發展，便會出現支氣管擴張症、肺纖維化等問題。
在韓國，有時會發生長期誤認為結核病，後來才確診的情形。此疾病可經由針對麴菌所做的過敏皮膚檢測、血清中總免疫球蛋白E、血清學特異免疫球蛋白檢測、麴菌相關沉澱素試驗、CT等放射線檢查等方式診斷。
雖然是侵略肺部的疾病，卻跟黴菌感染不一樣，屬於過敏免疫反應所引起的疾病，所以會使用類固醇當作治療藥物。為了治療黴菌，也會一併使用抗菌劑。近來也發現麴菌以外的黴菌也會引起症狀，故也會使用過敏性肺支氣管黴菌病（allergic bronchopulmonary mycosis，簡稱ABPM）的稱呼。
3.過敏性肺炎
過敏性肺炎（hypersensitivity pneumonitis）是黴菌造成的另一典型過敏性疾病。負責處理發霉乾草、麥稈或穀物的農夫或蘑菇工人身上會因嗜熱性放線菌（Thermophilicactinomycetes）而引起農夫肺或蘑菇工人肺這類肺部疾病。
因鴿子、鸚鵡、雞的排泄物而暴露在鳥類蛋白質之中，進而引起過敏性肺炎的飼鳥者肺也屬於著名的過敏性肺炎例子。不過有報告指出，棒狀麴（Aspergillus clavatus）透過發霉麥粒所引起的麥芽工人肺、隱基質皮層菌（Cryptostromacorticale）透過發霉楓樹皮所引起的楓樹皮工人肺、年代久遠的古宅中的皮膚毛孢子菌（Trichosporon cutaneum）所引起的過敏性肺炎、栽培蠔菇期間因蠔菇孢子而引起過敏性肺炎的蠔菇工人肺等，皆屬於黴菌為直接致病成因的情形。
