同一天，國民黨中常會根據紀律委員會的決議，撤除了吳國楨的黨籍和中常委資格。吳被撤除了公職黨職，對他來說，似乎是求仁得仁，因為他已五次上書請辭而未被接受。
但他並不甘休。他又再次上書蔣介石（1954.3.20），圍繞著國民黨經費、軍中黨組織和特務機關、特務干涉選舉情況、逮捕人民的人數、秘密監獄，以及救國團的隸屬等問題，提出十二項責難，要求蔣介石解答。
對於他在省主席任內「貪汙瀆職」的指控，吳國楨指出，他辭職至今將近一年，並沒有人控訴他貪汙瀆職，期間蔣還托宋美齡寫信請他回去就任總統府秘書長，而張其昀也以國民黨秘書長的名義來信請他迅速回去就任新職。但就在他上書國民大會後，忽然就憑空指控他各項罪名。不過，他仍歡迎政府派人來美調查他的經濟情況，並可將證據檢送美國法院，要求引渡。他也願意放棄政治庇護權到美國法院對質。但他提出警告，近代文明國家，凡提出罪狀，必須先舉出證據，而政府這次對他的做法卻是先提罪名，再羅織證據。他希望政府到國外打官司要有真憑實據，否則偽造證據若被人查出，會有損國家體面。他最後奉勸蔣介石以元首的地位，「下詔罪己，蟠然改圖。」（吳國楨，1995：556-559）
這封向蔣公開挑戰的信，刊登在美國華文報紙上，但臺灣報紙卻奉命不准刊登。吳國楨得知此事，是根據《合眾社》發自臺灣的電訊報導（1954.3.26）。另一則《美聯社》的電訊（1954.3.25）則說，蔣介石在國民大會閉幕辭中表示，「政府將歡迎有助於中國之批評言論，惟中國人利用在外國居留之安全來批評政府，實與共黨無異。」《美聯社》對蔣介石拋出這頂紅帽的解讀認為，這是針對吳國楨而發。確實，剛當上第二任總統的蔣介石，在國大會場上意興風發地斥責「奸匪的同路人」：他們要藉鉗制思想、束縛言論和秘密警察、特務橫行的不民主口號，來脅制政府，出賣民族。尤其是在國外，藉外國政治的保護和外國勢力的憑藉，來橫行不道，為所欲為，希圖達到其傷害國家反共復國的目的，這完全是共匪式的手段和行動。（歐世華，1999：125-126）
對吳國楨來說，蔣雖未指名，但紅帽一拋，已是蔣同他全面決裂的誓言。單槍匹馬，以一人敵一國，作為「奸匪同路人」的吳國楨難道不感到寒心嗎？更何況他「上有老，下有小」，小兒子還在臺灣當「人質」呢！然而，吳國楨似乎愈戰愈勇，絲毫沒有息事寧人的退卻念頭。他心裡是如何盤算的呢？
吳又一次上書蔣介石（1954.3.28），提到他自己過去曾規勸蔣介石應鼓勵成立反對黨的事，以及他為力爭法治而遞上辭呈時，勸蔣介石不要讓經國主持特務。蔣非但不接受，反而變本加厲，任由經國控制特務軍隊，操縱黨部。所造成的結果，他在信中直言無諱地指出，連他在最後一次辭職期間，也「幾遭暗算，險被殺身」。
