中央研究院院士臧振華和研究員李匡悌共同主持的台南科學園區考古計畫，成功奪下「世界考古論壇」頒發的「考古發現獎」。他們發現台灣最早的水稻化石、百萬餘件石器、陶器等文物，作為強力證據顯示最早的台灣、甚至東南亞史前文化，極可能來自中國東南沿海，對考古學有重要學術意義。
南科考古計畫在1996年12月正式啟動，從1995年到2010年期間，在南科及其周邊地區近3000公頃的土地上，進行5個階段的遺址搶救工作，共計有58處遺址被發現。當中選了34處進行了大規模的發掘，總面積達12萬多平方公尺。經過長時間的考察，發現出土的遺跡和古文物，涵蓋時間從距今300年前到5000年前，也在之中找到了台灣第一米和台灣第一狗。
臧振華指出，本年度世界考古論壇，共有來自世界各地的93項考古計畫提名，經過來自16個不同國家與地區的38位學術權威和專家所組成的評審委員2輪投票，選出21位得獎者，包括田野考古發現獎10項，及考古研究成果獎11項。
臧振華表示，從南科考古得到的眾多文物，為南島語族的來源提供了關鍵證據。過去南島語族分布廣泛，西到非洲東岸馬達加斯加，東到復活節島，4億人口有共通的語言，必然有其古代源頭。然而學界提出多項假說，有從中南半島、馬來西亞等，眾說紛紜。 （相關報導： 「生技園區爭議與學術自由無關」總統府反批陳建仁：狡辯 ｜ 更多文章 ）
臧振華也指出，這次南科考古支持了南島語族源自中國沿海，有更強的證據，應可否定源自更南邊馬來西亞等地的說法。臧振華也補充，此次得獎深具意義，證明台灣雖是小島，考古也受到世界關注。台灣出土文物比較本土，不像中國出土的玉器漂亮精美，不過也受到來自世界專家的重視。同時，中研院也將南科出土的人骨送到愛爾蘭，與都柏林大學的遺傳學實驗室合作，預計半年後會有結果，可望解答台灣原住民的起源問題。
