《脫歐協議》附加《北愛爾蘭議定書》，就高度爭議的愛爾蘭邊境做出規範，藉以管制愛爾蘭島內以及歐盟與英國間貨物流通。《北愛爾蘭議定書》強調，此議定書是歐盟與英國自脫歐起至雙邊完成正式協商之間的過渡安排，因而雙方將盡力在過渡期限二○年十二月三十一日前完成正式協商，藉以一部分或全部取代此一議定書的規範。然而，因為談判進展不可預期，議定書亦提供了英國在一九年七月一日前請求延長過渡期間。
由於愛爾蘭島內的特殊情況，歐盟與英國均不樂見硬邊界（hard border）的再度築起。因此《北愛爾蘭議定書》設計了英國與歐盟各自所涵蓋關稅領域的單一關稅區（the single customs territory）。此單一關稅區試圖建立一個歐盟與英國間的關稅同盟，在此架構下，英國與北愛爾蘭仍然在同一個關稅領域下。由於脫歐後的正式談判尚未完成，如何規範英國與歐盟間的關係並不明朗，因此議定書乃使用單一關稅區字眼。在此單一關稅區內，英國與歐盟將維持相同的對外關稅。
因為北愛爾蘭與愛爾蘭邊境相連，在貨物流通的規範上，北愛爾蘭受到單一市場規範的管制上將較為嚴格。議定書附件五部分遂列出一系列將適用於北愛爾蘭的歐盟內部市場規範。這個單一關稅區的安排有一個邊境保障機制（backstop arrangement），亦即若英國與歐盟雙方無法達成協議，這個單一關稅區將成為雙方關係的預設安排。
取消表決影響內閣威信
但是依據強烈脫歐派的主張，這個安排將阻礙英國徹底脫歐，脫歐大臣藍韜文辭職即根源於此。相同的，依據檢察總長的法律意見，《北愛爾蘭議定書》的規範，將讓英國在與歐盟未完成後續安排談判前不能合法脫歐。在後續協定談判期程無法預料下，其影響更為深遠。
由於英國特殊憲政規範，國際條約的生效並不以國會同意為必要條件。此項權力乃是國王特權（Royal Prerogative），因此，《脫歐協議》生效並不以下議院同意為前提，因而下議院同意，並非《脫歐協議》生效的要件。然而，此項議決具有政治影響，尤其《脫歐協議》的執行有賴英國以國內法之方式執行，取得國會的支持是立法程序之必要。
雖然文翠珊以不再續任黨魁為條件，挺過保守黨內的逼宮危機。但文翠珊因為擔憂無法取得下議院同意，在最後一刻取消議決，嚴重影響文翠珊內閣的威信，在正式舉行國會議決時，反對文翠珊的保守黨議員更可能與反對黨結合，同時對《脫歐協議》投下反對票，勢必將引發倒閣危機。
脫歐後續發展仍充滿變數。一方面文翠珊未能取得強烈脫歐者的支持，另一方面蘇格蘭國家黨等親歐派仍不放棄設法讓英國留在歐盟的最後掙扎。工黨黨魁科賓（Jeremy Corbyn）呼籲國會議員反對文翠珊的《脫歐協議》，主張脫歐計畫應走向全面性的關稅同盟。若文翠珊在國會對於《脫歐協議》的投票失利，形同不信任投票，將失去執政基礎，應全面改選，若無法進行改選，則應進行二次公投。
