衛福部與德國BNT第二回洽商：依據衛福部的列表：2020/8/20衛福部開始和BNT洽談，在2020/12/4與BNT與簽署保密協定。確定要購買500萬劑時，1/7 時BNT回復，新聞發布內容不可揭露價格及交貨期程，並請衛福部提供新聞稿內容供德方檢視。1/8衛福部於（台灣時間）上午9:58 將中英文新聞稿電郵寄送BNT檢視。BNT於下午4:53 回復對新聞稿內容無意見，原預計將於當日簽署合約。４小時後，BNT在晚上9:11 來電要求刪除中文新聞稿提到「我國」的部分。1/11德國BNT回復感謝衛福部修正中文新聞稿內容，將盡速回復，並對此延誤表達歉意。到了1/15時BNT回復表示，因重新評估上半年的疫苗供應量與供貨時程，故需將簽約時間延後數週。但之後我方持續聯繫均無下文，此案因有外力介入無疾而終。這是衛福部和BNT談判的過程。
疑點3：讓人好奇的是既然雙方簽有保密協定，那麼在雙方都還未對外發布新聞之前，何以「外力」會得知？而向BNT施壓？衛福部表示在後續的聯絡中均無下文。BNT的理由是「因重新評估上半年的疫苗供應量與供貨時程」，我方為何沒有抗議？阿中部長表示，我國和德國BNT談判時，對方因我方中文新聞稿出現「我國」二字，導致我方疫苗採購破局。這個說法顯然和指揮中心的列表略有出入，因為我方改為「台灣」，對方還感謝，經過四天之後才回復簽約延後。我駐德代表謝志偉在他的臉書表示，德國一位具醫療背景的國會議員Karl Lauterbach，在德國電視台（ZDF）政論節目上提到，台灣並非窮國、醫療體系也相當完善，「買不到疫苗只可能是政治因素」，主持人反問「那就是中國囉？」議員則回應「我也這麼詮釋。」這也就是陳時中與王必勝所稱的是中國的介入證據。
然而，根據德國BNT高層的說法，衛福部長陳時中大搞兩面手法，英文新聞稿寫「台灣」，但在中文新聞稿寫「我國」，認為陳時中沒有誠信，專搞小動作。至於德國政府是否有對BNT施壓？這位BNT高層表示，「德國外交部、經濟部都沒向公司施壓，因為這只是單純的國際商業行為，反而是台灣太複雜了。」明顯和衛福部的說法有很大的出入。
疑點4：依照謝志偉代表2021/7/13的臉書透露衛福部這次負責和BNT就疫苗採購合約聯繫的窗口Yuchen。「讀著每一封信，彷彿看到Yuchen一磚一瓦地搭蓋起一座可供家人／國人遮風避雨的家。一言一語，我深為Yuchen信裡細膩、謹慎的態度所感動。尤其看到1月6日的英文新聞稿裡要具體提到『共500萬劑疫苗。3月供應60萬劑，4月100萬劑，5月100萬劑，6月100萬劑，最後，7月140萬劑』時，我感到整個人都顫抖起來。」他進一步表示，在整個幕後協調談判過程中，各方都感受到「BNT高層自始自終對供應台灣疫苗的高度意願及熱誠。這也是為什麼，在BNT的網頁上，直到我撰文時，仍看得到其執行長吳沙忻（Ugur Sahin）先生昨天用英文寫的『BioNTech很高興能供應台灣人民歐盟製造的疫苗』」。2021/6/3謝的臉書上提到，台灣政府購買德國疫苗遇到阻力，「德國政府有沒有幫台灣，有！(德國)經濟部長親自出力，不夠用力？不，是中共力道更大。藥廠呢，有誠意，也有苦衷，但一切仍是進行式，我只能?......」謝代表在2021/8/22在立院答詢時表示，「1月到5月之間，我做的第一件事情，就是親自向德國官方確認『BNT疫苗可以賣的對象是誰？』答案是，這是緊急授權的疫苗，只能賣給國家。」試問：東洋和BNT洽商時為何可以爭取的BNT的授權？同樣後面鴻海的民間機構為何也可以BNT談而都沒有受到「緊急授權」只給國家的這樣的答案呢？（立委高虹安2021/7/3臉書表示，越南於5月向輝瑞藥廠洽購，6月7日簽約、6月12日批准緊急授權的3100萬劑BNT疫苗，首批97,110劑已在7月7日抵達越南了。她說，5月19日台灣宣布全台進入三級警戒時，她即大聲疾呼政府應儘速採購國際認證的疫苗，然而指揮中心多以「買不到疫苗」來回應呼籲。）
