前瞻計畫另起食安大樓 食藥署空間臨陣改為行政用途
根據行政院在2012年核定版本，「國家生技研究園區」以開發新藥為主要方向，著重於新藥研發與臨床前試驗，因此當初規劃進駐單位，包括科技部實驗動物中心、生物技術開發中心、衛生署食品藥物管理局（TFDA）、台灣生技整合育成中心等機構，園區完成臨床前試驗之藥物，可進一步交由新竹生醫園區等單位進行臨床試驗及後續新藥產製。
施明哲表示，未來南港生技園區將是國家級育成中心，除了上述單位進駐外，中研院的轉譯醫學研究與技術平台發展等單位也會進駐園區，中研院預計8月舉行招商說明會。
但就在即將完工前夕，原本有分配到食品安全實驗室的衛福部食藥署，卻準備另起爐灶，準備在前瞻基礎建設特別預算中，爭取50億元的「國家級實驗大樓」經費，時代力量立委黃國昌實地前往園區會勘F棟食藥署新大樓，發現這個斥資8.6億元的空間，原本規劃高解析質譜儀室、高磁場核磁共振室、以及動物實驗室，衛福部後來逕行變更規劃，全部改為行政空間，包括十幾間的行政主管辦公室。黃國昌質疑，衛福部在未經行政院同意下，就逕行變更行政院院會2012年核定的「國家生技研究園區」開發計畫，有違法之嫌。
食安實驗室離奇消失 中研院：進駐單位須與發展新藥相關
對於黃國昌質疑，施明哲解釋，國家生技研究園區當初設立目的，是為了「發展新藥」，因此進駐單位必須與發展新藥相關，工程會官員則表示，「國家生技研究園區」當初在發包統包工程以前，中研院有事先洽詢各部會建築物需求，衛福部當時表示，食藥署的藥品試驗，跟生醫新藥研發的定位不同，該園區實驗室，不符合食品安全實驗室需求。
儘管如此，目前利用白老鼠等動物試驗的科技部國家實驗動物中心，未來仍將按照原計劃，進駐生醫園區G棟大樓。
「蔡英文指責陳良基是誤傳」 科技部：生醫產創方案進度已超前
科技部生命科學研究發展司司長蔡少正表示，先前媒體報導，蔡總統對於「生醫產業創新推動方案」進度落後，指責科技部長陳良基，係屬外界誤傳，事實上，竹北生醫園區招商與台大醫院工程進度都超前，蔡總統6月底到竹北生醫園區，也對工程進度表達肯定。
蔡少正表示，針對「生醫產業創新推動方案」，科技部已成立執行中心，為了加速方案推動，科技部、衛福部、經濟部首長都擔任該中心指導委員，3個部會次長也是生醫推動小組成員。
