原訂去年4月完工的南港「國家生技研究園區」，如同台灣生醫產業發展縮影，從規劃到執行一波三折，不僅讓前總統馬英九在卸任前夕，當面指責前中研院長翁啟惠，新政府上台後，蔡英文總統也傳出對「生醫產業創新推動方案」推動緩慢感到不滿，指責科技部，最近在行政院公共工程委員會每周盯進度下，終於可望在年底完工，沒想到，當初規劃進駐的食藥署食品安全實驗室，卻準備在前瞻基礎建設特別預算，另外爭取50億元國家級實驗大樓，讓這個延宕多年的開發方案，又增加一段插曲。
南港生技研究園區 從扁時代起重大投資計畫
南港生技研究園區，是翁啟惠在扁政府時代，爭取到的重大投資計畫，不過，到了馬政府時代，卻陷入了翁啟惠與鴻海董事長郭台銘的角力，2008年8月前閣揆劉兆玄，率財經閣員拜會郭台銘，爭取鴻海在南港202兵工廠興建「數位環保科技城」，然而這個圈地造鎮計畫，卻也引發環保爭議，名作家張曉風在2010年驚天一跪、為南港202兵工廠內的濕地與綠地請命，鴻海投資計畫胎死腹中，「國家生技研究園區」的規劃，又從林口返回南港，為了保存綠地與埤塘，園區面積由原規劃之6.13公頃縮減至3.2公頃。
土地取得、統包規劃都延宕 施工又遭抗議 生醫園區工程多舛
不過，2012年5月行政院正式核定「國家生技研究園區」開發計畫，但實際執行的中研院，因為隸屬總統府，專責工程發包人員較少，加上國防部搬遷過程延宕8個月，原訂2016年4月完工的園區，在2015年12月馬英九視察進度時才發現進度嚴重落後，當場指責翁啟惠，當時正在競選總統的蔡英文，則替中研院說話，批評「總統好像搞錯了方向」，強調工程延宕主因，係國防部土地移交延宕。
綠營執政後，南港生醫園區的工程上緊了發條，考量全案開發金額高達90.1億元，中研院又缺乏專業發包人力，園區基礎構造，又必須開挖部分埤塘，工程困難性很高，行政院因此指定工程會專案協助；而為了做到當初承諾的濕地保育，除了採取統包工程外，部分結構還採取預鑄工法，加快施工進度。由於生醫園區工地，旁邊就是住宅區，施工期間大型機具進出，一度引發居民抗議，工程會還得承擔起與居民溝通責任。
中研院秘書長施明哲表示，南港生醫園區進度落後原因，除了國防部土地移交延宕8個月外，統包商規劃過程也略有延宕，施工期間還發生天候不佳與附近居民抗議情形。
據了解，由於總統蔡英文對於「生醫產業創新推動方案」推動速度落後頗為不滿，包括科技部、經濟部、工程會等相關單位，為了緊盯工程進度，每周還召開專案管理會議，希望園區其中2棟在8月中取得使用執照，另外5棟趕在11月取得使用執照，12月正式竣工啟用。
前瞻計畫另起食安大樓 食藥署空間臨陣改為行政用途
根據行政院在2012年核定版本，「國家生技研究園區」以開發新藥為主要方向，著重於新藥研發與臨床前試驗，因此當初規劃進駐單位，包括科技部實驗動物中心、生物技術開發中心、衛生署食品藥物管理局（TFDA）、台灣生技整合育成中心等機構，園區完成臨床前試驗之藥物，可進一步交由新竹生醫園區等單位進行臨床試驗及後續新藥產製。
施明哲表示，未來南港生技園區將是國家級育成中心，除了上述單位進駐外，中研院的轉譯醫學研究與技術平台發展等單位也會進駐園區，中研院預計8月舉行招商說明會。
但就在即將完工前夕，原本有分配到食品安全實驗室的衛福部食藥署，卻準備另起爐灶，準備在前瞻基礎建設特別預算中，爭取50億元的「國家級實驗大樓」經費，時代力量立委黃國昌實地前往園區會勘F棟食藥署新大樓，發現這個斥資8.6億元的空間，原本規劃高解析質譜儀室、高磁場核磁共振室、以及動物實驗室，衛福部後來逕行變更規劃，全部改為行政空間，包括十幾間的行政主管辦公室。黃國昌質疑，衛福部在未經行政院同意下，就逕行變更行政院院會2012年核定的「國家生技研究園區」開發計畫，有違法之嫌。
食安實驗室離奇消失 中研院：進駐單位須與發展新藥相關
對於黃國昌質疑，施明哲解釋，國家生技研究園區當初設立目的，是為了「發展新藥」，因此進駐單位必須與發展新藥相關，工程會官員則表示，「國家生技研究園區」當初在發包統包工程以前，中研院有事先洽詢各部會建築物需求，衛福部當時表示，食藥署的藥品試驗，跟生醫新藥研發的定位不同，該園區實驗室，不符合食品安全實驗室需求。
儘管如此，目前利用白老鼠等動物試驗的科技部國家實驗動物中心，未來仍將按照原計劃，進駐生醫園區G棟大樓。
「蔡英文指責陳良基是誤傳」 科技部：生醫產創方案進度已超前
科技部生命科學研究發展司司長蔡少正表示，先前媒體報導，蔡總統對於「生醫產業創新推動方案」進度落後，指責科技部長陳良基，係屬外界誤傳，事實上，竹北生醫園區招商與台大醫院工程進度都超前，蔡總統6月底到竹北生醫園區，也對工程進度表達肯定。
蔡少正表示，針對「生醫產業創新推動方案」，科技部已成立執行中心，為了加速方案推動，科技部、衛福部、經濟部首長都擔任該中心指導委員，3個部會次長也是生醫推動小組成員。
