參謀會報得到的結論以及國軍戰備的狀況，隨後就由相關單位向蔣仲苓簡報，因為當天中午，蔣仲苓將出席國家安全會議，討論政府的因應之道，並向其他的與會代表分析演習狀況；另外，國安會之後，蔣仲苓也將一刖往立法院，對朝野立委組成的「兩岸情勢因應小組」簡報演習情況。
這一天下午，蔣仲苓和副參謀總長兼執行官唐飛兵分兩路，蔣到立法院簡報，唐飛到行政院參加臨時決策小組會議；前者向立委保證捍衛疆土的決心，後者則提出預判，中共的演習將不會在十五日導彈演習完就結束，隨後，可能會舉行兩棲或三棲的演習，也出席這項會議的殷宗文，亦持同樣的看法。
立委們最關心的問題是，到底軍万對這樣的軍事挑釁行動，能採取什麼具體的反擊措施？還是只是一再的「忍耐」？民進黨團幹事長顏錦福追問，究竟到何種範圍內，我方才會反擎？蔣仲苓回答說，假如中共侵犯我領海主權，國軍將迎頭痛擊。顏錦福繼續追問，是不是在我領海十二浬內就要反擊？蔣仲苓對此不再正面答覆，他說，不能說得這麼露骨，否則應變會有困難。
據軍方將領指出，有關十二浬是否即為國軍反擊最後底線的問題，原則上應是如此，但仍必須視現場狀況而定；例如靠近十二浬而沒有進來，或者，進來的是漁船而非軍艦及飛機，又或者戰機或船艦越過海峽中線，要不要反擊？可能都得臨時應變。
各種狀況都有因應
蔣仲苓同時也表示，國軍並沒有反飛彈的能力，但是，假如飛彈打到我方的領土，國軍隨時可對中共任何一個地方進行反擎；不過，蔣仲苓也指出，中共飛彈應該不會「打偏射中台灣」。至於中共可不可能攻打外島？蔣仲苓並未正面回答，他只說國軍對各種狀況都有所因應。
據軍方將領指出，有關反擊的問題，會是一個很棘手的問題，首先，這次中共可能發射的導彈是M族飛彈，這種飛彈的陣地是機動的，而且，從江西省就可以發射，不用非得到福建來，所以，想要摧毀它並不容易。一來我方沒有射程夠遠的地對地飛彈去攻擊它的基地，二來即使是用戰鬥機去攻擊，航程和破壞力可能都有問題，因此，反擊飛彈基地的可行性不高
如果不能摧毀飛彈基地，可能的反擊方式，可能包括以空對地飛彈攻擊飛機場或彈藥庫等地方，但是這打下去的效果有多大不可知，萬一沒命中反而貽笑大方，而且，無可避免的戰爭必定全面到來。所以，目前這樣的狀況，安定民心，降低人民的恐慌，可能是比軍事戰備或反擊更重要的事。而這也就是國防部迅速召開記者會，解說M族飛彈性能的原因。
六日下午記者會的目的，主要在澄清幾個民眾的疑慮，第一，M族飛彈可不可能「誤打」到台灣本島？中科院主管飛彈業務的二所所長王鴻智說，M9的最大射程是六百公里，圓周誤差率三百到六百公尺，如果發射一百枚飛彈，有五十枚、五○％會落在六百公尺的半徑圓周內。
