非洲醫療匱乏、不易取得水資源，專家擔憂非洲會成為新冠肺炎（武漢肺炎）疫情重災區，不過官方數據來看，新冠病毒在非洲的傳播速度卻較為緩慢。《經濟學人》16日分析指出，非洲確診病例僅占全球2%，可能是因為篩檢次數不多、且多國政府及早實施封鎖，才遏止疫情大爆發。不過基於部分國家意圖鬆綁封鎖措施，也有部分政府蓋牌、企圖掩飾疫情，學者推估非洲疫情可能不會出現指數式大爆發，但流行期會拉長。
西非國家迦納總統阿庫佛艾杜（Nana Akufo-Addo）於4月10日的全國談話指出，該國港口城市特馬（Tema）出現「超級傳播者」，在一間魚肉加工廠將病毒傳染給533人，占全國5408確診病例的10%。《經濟學人》（The Economist）認為，迦納能夠鎖定超級傳染者，要歸功於該國防疫措施。根據非洲疾病管制預防中心（ACDC），迦納是非洲人均篩檢率第四高的國家，目前已有超過15.5萬人接受篩檢。
非洲確診病例僅占全球2%，為什麼？
非洲總人口占全球17%，但確診病例占不到全球的2%，截至5月13日為止，非洲疾病管制預防中心統計共有6萬9947確診病例，其中2410病例死亡。而過去一個月中，非洲的病例新增速度約每兩週翻倍，美國近期則是每三天翻倍。
這可能反映非洲篩檢數不足，事實上，疫情爆發以來，全非洲僅檢驗了100萬人次，光是南非和迦納就占了整個大陸半數的篩檢量。實證基礎新冠肺炎應對合作組織（Partnership for Evidence-Based Response to Covid-19）指出，實際的肺炎感染狀況可能比帳面數字還要嚴重，並推估確診數約為已知的八倍。
另一個警示則是非洲篩檢結果的陽性比例。美國史丹佛大學（Stanford University）傳染病專家安德魯斯（Jason Andrews）表示，雖然陽性比例不是理想的指標，但鑑於接受檢驗者都有疑似武漢肺炎的症狀，若陽性比例超過5至10%，那就代表還有更多未確診的病例。目前非洲至少有22國篩檢結果的陽性比例超過10%，如阿爾及利亞的91%、蘇丹87%和坦尚尼亞的78%。
坦尚尼亞總統馬古富利（John Magufuli）不信任篩檢結果，妄稱該國檢驗中心混雜木瓜和山羊等樣本進行篩檢，才會出現如此嚇人的陽性比例，而4月29日以來，坦尚尼亞官方停止更新確診數字。不過根據非政府組織和運動者，坦尚尼亞最大城沙蘭港（Dar es Salaam）進行許多武漢肺炎死者的喪禮，5月12日美國大使館也指出當地醫院人滿為患。
其他國家也出現類似狀況，但感染人數並未加總至官方確診病例。例如在奈及利亞第二大城市卡諾 （Kano），當地掘墓工聲稱有數百名往生者死因不明，而索馬利亞首都摩加迪休（Mogadishu）醫護人員則表示他們在工作中見證的死亡數，和官方數據並不吻合。
不過並非所有非洲國家都試圖掩蓋疫情擴散。像是納米比亞（Namibia）和印度洋上的模里西斯（Mauritius）和塞席爾（Seychelles），已14天未通報新病例，而東非的衣索比亞（Ethiopia）、烏干達（Uganda）和盧安達（Rwanda）三國確診總數低於700，篩檢結果陽性比例低於1%，沒有出現確診數字飆升情況。衣索比亞在野黨領袖內加（Berhanu Nega）表示：「像我這樣的社會，確診數據不可能保密。」
Sub-Saharan #Africa could potentially be hard hit by the #coronavirus.
— World Bank Health (@WBG_Health) April 21, 2020
Our health economists offer advice to policymakers on how to ensure effective allocation of #HealthFinancing to combat #COVID19: https://t.co/EbOZmRChHW #InvestInHealth @WorldBankAfrica pic.twitter.com/U9YZfKPUnb
疫情在非洲「悶燒」 影響時間拉長
非洲國家及早實施遏止病毒傳播的措施，是遏制疫情的關鍵，大多非洲國家都比富裕國家還要早進行封鎖（lockdown），管制人民及交通活動。根據四月底統計，超過42個非洲國家實施封鎖，其中38國的封鎖期間長於21天。
雖然非洲沒有出現類似歐美國家指數式的疫情大爆發，但WHO非洲地區負責人莫耶提（Matshidiso Moeti）認為，武漢肺炎可能會在交通運輸熱點「悶燒」。根據WHO成員在線上期刊《BMJ全球衛生》（BMJ Global Health）發表的研究報告，考慮到非洲獨特的社經背景（像是公路交通不發達所以人民較少旅遊），武漢肺炎在非洲的傳播會變緩慢，但流行期也會拉長。
研究報告顯示，若沒有配套防疫措施，在武漢肺炎流行的第一年，非洲WHO會員國將有16至26%人感染，而在交通較方便的國家如南非，感染率會更高。此外，約2.9千萬至4.4萬人會出現相關症狀，推估死亡病例則在8.3萬至19萬之間。該報告預測非洲的武漢肺炎死亡率比富裕國家低，可能是因為非洲人口結構較為年輕，不過非洲的醫療設備不如已開發國家，大規模疫情可能癱瘓醫療系統。
由於這份報告沒有考量到封鎖等防疫措施的影響，所以推估感染率和死亡率比實際狀況稍高，不過目前許多非洲國家為了平衡肺炎疫情帶來的經濟衝擊，計畫逐步鬆綁封鎖限制。目前許多已開發國家推估疫情已經達到理論值的頂峰，於是慢慢放寬封鎖令，但非洲仍處於確診加速期，儘管迄今為止疫情擴散速度並不如義大利和美國嚇人，但鬆綁管制的風險仍然很高。
