因私菸問題讓總統蔡英文出訪成果「歪樓」，導致國安局長辭職下台。隨著檢調體系開始偵辦與交通部積極處理華航問題，這個由國安局特勤中心、總統府侍衛室與華航等單位的集體出包，之後可能就待司法單位調查結果，以釐清真相與責任。
雖然私菸問題容易吸引輿論聚焦，但此事真正問題是紀律廢弛導致的國安疑慮。前陸軍司令邱國正上將臨危受命入主國安局以重整紀律，但我們也希望能利用這個時機改革以國安局為首的情報體系，畢竟這是與國家安全最直接的問題。
把特勤中心獨立於國安局之外
私菸事件使國安局特勤中心成眾矢之的，隨著國安局長辭職後，大家又發現特勤中心雖隸屬國安局，但負責總統、副總統維安事宜的實際上是總統府侍衛室，在陽明山上的國安局長，對於在府內的侍衛室很難有實質的日常管理，這也讓特勤中心獨立於國安局之外的呼聲再度出現。
由於總統、副總統維安與做為情報單位的國安局，在任務上不太一樣，兩者分屬不同專業。前者在明，以保護自家人為主，後者在暗，低調監偵敵情。因特勤中心前身「聯合警衛安全指揮部」，當時就是仿照美國秘情局（原隸屬財政部，後改隸國土安全部）而成立的獨立單位，剛開始不隸屬國安局，直到一九八九年才納入國安局指揮。所以如果國安局對特勤中心還持續有管理的實際困難，加上兩者也存在不同的任務要求與組織文化，還是須考慮將特勤中心移出國安局。
根據《國家安全局組織法》，國安局隸屬於國家安全會議，綜理國家安全情報工作與特種勤務之策畫及執行，本質上就規定了國安局的本業就是情報，所謂的特種勤務也是與情報工作相關而發展出來的任務。更因在二○一四年七月通過《情資彙送作業辦法》，使得做為情報主管機關（律定於《國家情報工作法》）的國安局，能迅速掌握其他情報機關收集的情資，這使得國安局長變成類似美國國家情報總監（ＤＮＩ），掌握全國所有訊息，職權比美國中情局長大。
國安局需強化情蒐能力
情報工作分為情蒐、情研與情戰，而情報來源可粗分為人因情報（我方的公開與祕密人員探知的情報）、科技情報（訊號、地理空間與測量識別），以及公開情報（open source intelligence）。情蒐絕對是情研與情戰的基礎，情蒐力是情報有效與否的決定性因素。國安局的情蒐力更需要大幅加強。
科技情蒐力可以透過技術投資與訊號判讀訓練而取得，但因情報所能取得的細節是科技情報效度的關鍵，非大數據（Big Data）或人工智慧（ＡＩ）等技術可取代，因此不存在不夠強化的問題。
此外，因國安局長過去多由軍方背景出任，導致高度重視中國軍事相關情資的文化，但現在的安全議題已不限於軍事領域，包括金融、社會、經濟、醫療議題等攸關國家運作領域的情報能力，都該是重點，這不是傳統國關或政治訓練的人可以掌握。因此，網羅前述方面的專家與強化情蒐能力，同時招募可運用大數據與人工智慧能力的資訊科學家，來強化情報蒐集、篩選與判讀，也是當務之急。 （相關報導： 追私菸案逢氣爆5周年！藍黨團質疑蔡英文「百般保護」 要求陳菊出面負起政治責任 ｜ 更多文章 ）
軍、文矛盾，各處爭功互槓
現在國安局的情戰功能較有限，這與組織法及處務章程有關，國安局可以為了中國情蒐而布建，可是沒有美國中情局的祕密任務權限。但因中國已具全球存在感，其一帶一路、孔子學院及混合戰等都是全球任務，因此對中情蒐現在也需要擴及其他國家。特別是當中國對台情戰與策反，有不少是透過其國外情報站執行，國安局的對中情戰，也就必須包括對友中敵台國家的情戰（不止於情蒐）等任務了。
