儘管解放軍使用無人機擾台有不少優點，但無人機的缺點也很明顯。許智翔指出，美國在中東打「反恐戰爭」時，大量使用無人機，出奇制勝的主因是因美軍處於敵軍完全沒有防空能力的戰場環境。但台海周邊佈滿防空火力，一旦開戰，航速慢、機動性又差、且不具匿踪能力的無人機，很容易就被擊落並解體。只不過，台灣現在礙於避戰、不主動挑釁的處境，應對解放軍無人機這種航速慢、航時長的「入侵」，反而綁手綁腳。他說，台灣或日本軍方不可能派遣戰機升空監控，因為要高速飛行的戰機盯住機體小、又飛得慢的無人機，難度高，飛行風險也大，再者，用操作成本動輒相差幾十倍的戰機來應付無人機，也極不划算。
許智翔指出，相對於價昂的戰機和飛行員，無人機若被擊落，兩軍衝突應不至升高。以伊朗2019年擊落美國無人機為例，當時的美國總統川普政府並未強烈反彈。但台灣局勢較為緊繃，中共無人機若失控誤闖領空、墜毀甚至成為中方施壓的藉口，台灣如何因應，牽動敏感的政治神經。
位於台北的《軍情與航空》網站主編施孝瑋表示，台灣可以改用慢速機追踪無人機，或「以無人機對付無人機」，來減少操作成本跟風險。施孝瑋告訴美國之音：「美國現在可能通過總統授權法案，還有軍事融資，要讓台灣快速擁有美軍現役的MQ-9A無人機，能夠在海峽上空長時間監控大陸在台灣周邊的無人機的飛行。」
分析人士說，除了戰機武器，台灣也可仿效韓國，成立直屬國防部的「無人機作戰司令部」，從指揮體系統合各軍種來執行監偵、攻擊等任務。
無人機恐導引中共攻台的「擊殺鏈」
若兩岸開戰，台北學者許智翔認為，台灣須先瓦解中共以大型無人機偵蒐、導引飛彈或船艦攻台的「擊殺鏈」（kill chain）。接著解放軍若登陸，兩軍進入地面戰，屆時各種中小型偵查或自殺無人機也恐將登場。在台海這麼高強度的戰場環境下，無人機的數量恐將主導勝負的關鍵。
也因此，中方密切關注美軍研發無人機的進展，北京「中國指揮與控制學會」9月3日就轉載一份美方兵推結果示警。
這份由美國空軍與智庫蘭德公司合作進行的「防禦台海行動」兵推報告指出，美軍將打造「多域無人機蜂群」，這種「大量低成本的無人機，將混淆中方的戰區意識，使其難以辨識高價值（打擊）目標，而浪費昂貴的先進防空武器」，兵推結果顯示，這可以有效減少美軍戰機在台海衝突中的耗損，並擴大解放軍的戰機損耗。
對此，軍事欄目主持人馬克表示，美國空軍正在研發「空中博格（Skyborg）」，這項低成本的自主無人機系統將進一步在質跟量上，改變無人機在未來戰場的運用。馬克說：「這種所謂的可消耗性無人機，它實際上是一種人工智能支持下的無人機，它具備一些有人機可以實現的能力，包括自主飛行、對空對地作戰、空中格鬥的一些能力，可以去執行一些高風險任務。」
隨著解放軍無人機擾台的架次增多，台海空防的遊戲規則勢必將受到顛覆。
