伊斯蘭國組織在東南亞，尤其是大馬、印尼及菲律賓受到部分穆斯林的支持，這些國家有人飛往中東參與聖戰。大馬內政部長阿末扎希透露，警方在去年逮捕了四十六名企圖前往敘利亞參與伊斯蘭國組織戰鬥的大馬人，這些人不少是公務員，也有前軍人。大馬警方也估計，約有一百名大馬人目前身在中東參與聖戰。大馬已經採取各種反恐措施，包括預防性逮捕行動，政府也將於今年三月在國會提交反恐法令，抑制恐怖主義的抬頭。易騰研究中心研究主任藍中華表示，目前伊斯蘭國組織對大馬的影響還是受到控制，這是因為大部分民眾不認同IS的理念，雖然穆斯林都不能拒絕聖戰。他指出，大馬激進伊斯蘭組織對IS的支持出現分歧，因為之前在東南亞活躍的伊斯蘭祈禱團（JI）是與基地（蓋達）組織結盟，他們因此無法背叛基地組織而轉向投靠從基地組織分裂出來的IS。
儘管如此，大馬情報部門也發現，大馬境內新成立四個穆斯林極端組織，分別是BKAW組織、ADI組織、BAJ組織和Dimzia組織。據調查這些組織成立時間不到一年，彼此之間不受管制，分散在各地從事分裂活動，但它們有一個共同的目標，那就是本著「天下穆斯林為一家」的精神理念，意圖在亞太地區建立起一個「伊斯蘭國」。這個目標與IS及菲律賓南部臭名昭著的「阿布沙耶夫」相一致。阿布沙耶夫已公開宣布支持IS，不過，大馬的激進組織至今仍未表態。
IS在中東的迅速壯大引起了大馬、印尼等東南亞國家領導人的強烈關注，他們開始對「伊斯蘭國」勢力在本國擴張的前景感到擔憂。印尼總人口約為兩億五千萬人，八成人口信奉伊斯蘭教，是世界上穆斯林人口最多的國家。大馬總人口近三千萬，六成人口是穆斯林，伊斯蘭教為官方宗教。為制止IS等激進宗教勢力的發展，不久前，印尼政府發布禁令，禁止穆斯林信眾參與IS組織及活動。大馬首相納吉也發表措辭嚴厲的聲明譴責IS，指出其思想和行為是反人類的，與伊斯蘭教教義、文化不相符。
利用社交媒體傳播
東南亞各國及中國政府最大憂慮是，在中東參與聖戰的支持者把在戰場上累積的軍事與爆破經驗帶回國，把IS的鬥爭理念擴展到東南亞。根據警方的情報，部分大馬和印尼早期加入IS的宗教極端分子已經回國展開招募，並負責聯繫接應，把招募來的聖戰分子運送到IS控制區。根據大馬警方逮捕的IS支持者，他們都是通過臉書、推特等社交媒體和宗教討論活動等形式被招募。大馬戰略與國際研究所的恐怖主義研究人員艾琳娜分析說，IS在大馬通過演講和傳教等方式，吸引了來自城市和鄉村不同背景的年輕人。她表示，這些熱血青年對宗教狂熱認識不足，夢想加入所謂的「聖戰」以拯救在伊拉克和敘利亞受壓迫的遜尼派伊斯蘭教徒。大馬穆斯林以遜尼派為主流。
