據媒體報導，內政部移民署編列紓困振興特別預算追加預算案--移民署建置旅客訂位及行程分析系統(Passenger Name Record，PNR)踩到個人資料人權紅線，移民署強調，已導入嚴謹之資訊安全及個資稽核保護管理制度，並有ISO認證，每年辨理資訊安全內外部及專案稽核，強化個資保護及資訊安全，確保民眾個資無外洩之虞。
據內政部移民署規劃，PNR系統係利用旅客旅遊訂位相關資料，包括基本資料、行李、抵達地、付款和機票、轉機資訊，進行大數據分析。藉此掌握染疫旅客的造訪點與艙座，同時找出艙座鄰近旅客，作防疫管控。
另針對PNR個資保存年限，未來將衡酌個資運用必要性，訂定適當保存年限。經入出國及移民署報請上級機關目前同意依規定保存之個人資料，自其身分轉換為居住台灣地區設有戶籍國民，後6個月內刪除之。即指紋、面部識別等資料，最多保存20年，若為台灣民眾只能保存6個月。
移民署澄清說明，公務預算經費1,775萬元係為提升國境安全資訊建置計畫，包含大數據系統開發及改造桃園機房，並非只有PNR系統建置預算。移民署進一步表示，PNR的建置係為因應未來國際旅遊解禁後，防範疫情可能捲土重來之「阻絕病毒於境外」之特別考量，將全力作好系統建置與個資保護之萬全準備！
