在成大醫院工作七年後，吳炎村轉往台南的郭綜合醫院任職，後來又到新營另一家私人醫院。
2003 年，他接到一通改變命運的電話。時任若瑟醫院副院長的蔡孟宏醫師，邀請他到復健科任職。「我們醫院的復健科醫生要離職了，這裡很缺您這種專業人才，鄉下老人又多，而且這間醫院很特別，神父們做什麼都是先想到需要的人，還有很多需早期療育的小病人需要照顧……來幫忙吧！拜託啦！」
當時，吳炎村其實已答應到台東基督教醫院服務，但考慮到若瑟醫院即將沒有復健科醫師，而台東基督教醫院還有，黄院長的叮嚀在腦海中響起。該去哪裡，答案已經很清楚。
肩負照顧早療兒童的使命
台灣的早療工作起步較歐美晚，傳統上常認為小孩子「大隻雞慢啼」（台語），部分家長因而忽略嬰幼兒的發展遲緩問題。直到1990年代，隨著經濟發展和觀念進步，在家長與兒童福利、身心障礙團體的推動下，早期療育才漸受重視。
1995年內政部成立早療推動委員會，1999年成立兒童局，之後幾年，社政、教育和衛生醫藥部門陸續與民間合作，在全台建構通報體系、評估模式與專業療育做法，並立法將早療服務相關條文落實在各級法規，各縣市政府陸續展開早療培訓計畫。
然而雲林是農業縣，民眾所得偏低，資源有限，要做早療並不容易；尤其偏鄉的環境遠不如都市，做早療要花費很多的成本和人力，多數醫院不願意投入。再加上偏鄉的隔代教養和新住民家庭快速增加，親子互動和語言刺激較少，出現發展遲緩的現象也容易被忽略，因而錯過黄金治療期，對家庭、教育成本及社會福利，都將形成負擔。
2000年，家扶中心開始籌劃早期療育服務方案，並接受雲林縣政府委託成立早期療育組，次年進駐西螺兒童福利館成立早期療育中心及設日托班，為雲林的早療工作跨出了穩定的步伐。
2002年，端木梁醫師在復健科擔任主任時，若瑟醫院開辦雲林縣第一個兒童發展聯合評估中心，隔年吳炎村到職，擔任復健科醫師，一肩挑起找出並幫助這些孩子的任務，更走出醫院，前進到交通更不易、資源更匱乏的鄉鎮，在第一線幫助孩子。
2004年若瑟醫院開辦斗六早療中心，2008年承辦口湖早療中心，2009年承辦台西早療中心，那些年同時支援斗六長照中心和雲林特教學校等單位，吳炎村親自到各據點看診，觀察孩子們的認知、肢體和語言發展，再與治療師擬訂適合的治療及復健方式。
前往偏鄉，來回車程至少兩小時。吳炎村早上在醫院看診，中午一結束就要立刻出發，趕在下午一點半抵達朴子或口湖。為此，太太蔡明珠當起司機，整整十年，夫婦倆趕路的身影穿梭在雲嘉鄉野。
