為報答台灣在過去311震災與疫情初期給予的大力協助，日本於6月4日親自派專機來台，贈與我國共124萬劑的AZ疫苗，對目前疫苗短缺的台灣來說，無疑是疫情下的及時雨。不過令人好奇的是，身為傳統醫療大國的日本，目前手上至少握有上億劑的新冠疫苗，照理來說，應該會有較高的疫苗覆蓋率，但根據《Our World in Data》統計數據顯示，日本國內至今仍有8成左右的民眾尚未接種疫苗，速度甚至比許多發展中的國家還要緩慢，讓人不禁納悶，明明擁有足夠疫苗的日本為何施打率這麼低？
細究之後發現，這或許得歸咎於日本的一段黑歷史，人稱日本疫苗產業空白的30年...
身為世界上數一數二的醫療強國，日本在1975到1989這15年間，至少研發了160種新藥和疫苗，對於水痘、日本腦炎和百日咳等疾病，日本也擁有極高的疫苗技術水準，就連美國也要向其尋求支援。然而好景不常，日本後來在疫苗政策與施打上出現一連串的問題，最終釀成了多條人命的喪失。
在美軍佔領日本時期，由於當地民眾普遍未有良好的醫療衛生觀念，為了要遏制傳染病在民間蔓延，美方因此建立了「強制接種疫苗」制度，對於不願施打疫苗的民眾，甚至會進行大動作的圍捕、強迫施打。雖然這套制度明顯存在爭議，但不可諱言的是，疫苗的施打的確挽救了當時許多日人的性命，這也讓戰後的日本政府決定繼續沿用，並頒布《預防接種法》，規定所有6歲以下的嬰幼兒都必須在疫苗中心施打預防針。
針頭重複使用，68名嬰幼兒接種白喉疫苗後死亡
雖然強制接種疫苗確實能有效預防流行疾病，但當時日本的醫療觀念卻未能及時跟上腳步，不知道針頭不可重複使用，甚至直到1988年，官方才修法禁止重複使用針頭，導致在此之前接種白喉、百日咳等疫苗的嬰幼兒當中，至少有68人死亡、逾43萬人感染B型肝炎。
麻疹疫苗引發腦膜炎，日本政府付巨額國賠
時間到了1993年，在日本政府推動「麻疹腮腺炎德國麻疹混合疫苗（MMR）」施打時，出現民眾在接種疫苗後引發腦膜炎的情況，導致厚生勞動省為此付出巨額國賠。也因為這樣，隔年日本當局下定決心修改《預防接種法》，將「強制接種」疫苗的規定，改為「強烈建議」民眾接種，以避免再有訴訟纏身，而當局對施打疫苗的立場，也就此搖擺不定。
HPV疫苗接種率不到1%，2萬名女性罹患子宮頸癌
然而事情還沒有結束，根據《公視新聞網》報導，在2013年時，日本推動實施「人類乳突病毒疫苗（HPV）」施打後，有部分青少女出現肌肉痠痛、睡眠障礙等副作用，隨即再度引發爭議，讓當局最後放棄建議施打HPV疫苗的政策。根據報告顯示，日本在2020年4月的HPV疫苗接種率，已從70%大幅滑落至不到1%，這也導致有超過2萬人罹患子宮頸癌，甚至有5000多人因罹病死亡。 （相關報導： 新冠肺炎》舉台灣、新加坡為例，泰總理：自產疫苗是最佳方式，感謝做出這個建議的專家們 ｜ 更多文章 ）
類風溼性關節炎藥物劑量過重，22人罹患間質性肺炎、其中9人死亡
此外，由於日本政府在2003年時，在沒有經過本土最終階段試驗的情況下，就將類風溼性關節炎藥物「來氟米特（Leflunomide）」批准上市，最後造成至少22人罹患間質性肺炎、其中9人死亡的悲劇。後來經調查後才發現，原來是該藥物在日本核准使用的劑量，對日本人的體質來說屬於過量，這也導致日後日本民眾對於來自國外的藥物有所卻步。
