中國科技部副部長徐南平29日接受中國央視記者訪問時表示，科技部堅決反對基因編輯嬰兒事件，已經採取行動，暫停南方科技大學副教授賀建奎的科技活動，下一步將在客觀調查的基礎上，會同有關部門依法依規做出查處。
徐南平強調，以生殖為目的的人類胚胎基因編輯的臨床操作，在中國是明令禁止。基因編輯嬰兒事件公然違反中國相關法規條例、公然突破學術界堅守的道德倫理的底線，令人震驚，不可接受。
「基因編輯嬰兒」計畫領導人、南方科技大學副教授賀建奎26日宣布一對「基因編輯嬰兒」「露露」和「娜娜」於11月在中國「健康」誕生。賀建奎聲稱這對雙胞胎的一個基因經過修改，能夠「天然抵抗愛滋病」。
賀建奎28日現身第二屆人類基因組編輯國際峰會，親口承認「基因編輯嬰兒」露露和娜娜已在中國出生的消息。但是專家指出，基因編輯直接應用在人體身上，會有產生「脫靶效應」的風險，從而會在基因組（基因體）中引入不可預估的突變。
針對有報導稱美國萊斯大學（Rice University）迪姆（Michael Deem）教授參與「基因編輯嬰兒」研究一事，萊斯大學發表聲明說，正在對該教授展開全面調查。這一研究引發「令人不安的科學、法律和倫理問題」萊斯大學毫不知情。
清華大學愛滋病綜合研究中心常務副主任張林琦表示：「這事件已經遠遠超出了技術問題的範疇，後果不可預測，一定是倫理爭論的焦點。即使技術100%可靠，人類是否可以或應該編輯自己的生殖細胞和胚胎，絕大多數人肯定大腦一片空白，包括我自己。」
中國工程院28日晚間發表聲明：「我們深切關懷據稱已出生的兩名嬰兒。呼籲社會各界對她們的隱私給予最嚴格的保護，研究制定細緻的醫學與倫理照護方案，防範這種基因編輯可能產生的健康損害，以社會所能提供的最充分的關懷方式，使她們能夠在心理上和生理上健康快樂成長。」
中國國家衛健委、科技部28日晚聯合回應稱，相關部門正在進行調查核實，國家衛健委、科技部始終重視和維護人民的健康權益，開展科學研究和醫療活動必須按照有關法律法規和倫理準則進行，對違法違規行為堅決予以查處。
全國人大憲法和法律委員會委員、中國社科院法學所研究員孫憲忠指出，在法律上，自然人就是自然狀態下的人，這是生命健康的自然倫理，也是全世界都遵守的自然法則。人是主體不是客體。人的生命健康，包括生命的組成部分不可以被機械式創造，不可以按照他人的意志被創製，被轉移，被塗銷。
中國原衛生部在2003年7月頒布的《人類輔助生殖技術規範》明確規定，「禁止以生殖為目的對人類配子、合子和胚胎進行基因操作」。 換言之，不以生殖為目的的人體胚胎基因編輯研究可以進行。
2003年12月，由中國科技部和原衛生部制定的《人胚胎幹細胞研究倫理指導原則》規定，可以以研究為目的對人體胚胎實施基因編輯和修飾，但必須遵守14天法則：利用體外受精、體細胞核移植等技術、在研究範圍內獲得的人類胚胎，其體外培養期限自受精或核移植開始不得超過14天。
陸媒指出，賀建奎這項以生殖為目的並進行了一個妊娠周期的試驗研究，已經違反了相關規定。但有學者表示，《人胚胎幹細胞研究倫理指導原則》的法律約束性不強，難以起到警示和管理作用。
另有學者指出，中國基因治療立法嚴重不足，雖然有《基因工程安全管理辦法》《人類遺傳資源管理暫行辦法》《人類輔助生殖技術管理辦法》等相關規定，但並沒有專門針對基因治療的法律規範。 （相關報導： 走火入魔的中國夢？搞出「基因編輯嬰兒」爭議 中國科學家賀建奎：我為研究成果感到自豪！ ｜ 更多文章 ）
「基因編輯嬰兒」誕生後，必然會面臨成年後結婚生子的問題，而被編輯過的基因極有可能會遺傳給下一代。中國《婚姻法》規定，「患有醫學上認為不應當結婚的疾病」禁止結婚。「基因編輯嬰兒」是否屬於此種情況？中國政法大學傳播法研究中心副主任朱巍表示，目前「基因編輯」的副作用並沒有得到證實，在尚未發現「基因編輯嬰兒」生育後代存在疾病風險的情況下，結婚生育是她們的基本權利。
