疫情初期，中國政府的審查系統對自媒體同樣實施嚴厲管控。
1月25日至3月24日武漢封城期間，湖北作家方方一共寫了60篇日記，讀「方方日記」成為當時很多中國人的必修課。但是，方方的日記並不是每一篇都能倖存下來，大部分被刪除，發表日記的微信公眾號也不斷被封，不斷轉世。
《方方日記》遭遇的審查並非孤例。
2020年2月5日，武漢封城不久，中國國家網信辦指導有關地方網信辦， 依法查處違法違規網站平台及賬號，尤其對「散佈疫情信息」的賬號進行「嚴肅處理」；同時，微信以「傳播惡意謠言」為由，大規模封號，被封號的網民在微博創建了一個「微信封號」的超話，不少網民表示悲傷與憤怒。但到2月5日，「微信封號」超話話題便被刪除。
3月1日，中國互聯網言論管控新規正式實施。有不少中國網友認為，這是2013年之後最嚴厲的一次言論控制：當局不僅封殺言論，同時封殺相關微信號主人；不僅封殺中國國內而且封殺海外華人；並且，將網路警察建到縣一級，各大網站必須對網警開放。
隨著審查的升級，曾經在在網路上鋪天蓋地的有關武漢疫情的帖子也迅速消失。在武漢封城期間，到底有多少自媒體文章和帖子被刪除？這幾乎是不可能統計到的數字。
在Github項目《2020新冠肺炎記憶：傳媒報導與非虛構寫作》和中國數字時代統計基礎之上，記者經過數月整理，大致整理出229篇被刪除的自媒體文章，但這或許仍然只是冰山一角。實際上，有許多當時被立即刪除的文章沒有辦法統計到。此外，有些當時被刪除的文章，此後會被其他平台轉載，便不在此之列。比如《方方日記》60篇，只有11篇還留在原發的公號「二湘的十維空間」，「二湘的十一維空間」等，但後來財新網站刊登了所有日記，所以沒有統計在內。
與主流媒體的報導相比，自媒體文章更為靈活、也更深入到各個社會層面；同時也更加犀利、大膽觸及疫情中的各個問題。也正因為如此，自媒體文章「消失」得也更多、更快，幾乎每一天都有文章被刪除，敏感的日子裏，多到七八篇熱傳文章「消失」。
一些有醫學背景的企業的自媒體平台如丁香園、偶爾治癒、八點健聞在武漢疫情報導中特別突出，也遭到更為嚴格的審查。
在當下中國人的閲讀中，微信公眾號是最重要的平台，這也是審查最為嚴格的地方。從發表平台統計數字細看，229篇被刪除的文章有大約百分之八十來自於微信公眾平台。
