不過，在民進黨政府上台後，2016年底教育部對明道大學的海外推廣業務，指派國富浩華聯合會計師事務所進行查核，發現有部分海外推廣教育收入未入帳。明道大學主管解釋，之所以會發生帳務不符，主要係因蠡澤公司除了代收陸生學費之外，同時還代為管理明道大學上海辦事處，因此，蠡澤公司在支付該校陸生學費應收款以前，會將上海辦事處的代管費用予以扣除。
不過，教育部方面認為明道大學在處理海外教育推廣收入時，將應收與應付款相抵的作法，違反會計處理原則，因此要求明道大學限期改正，後來並且罰款100萬元。
「2億收入都有進學校帳戶，沒被掏空」
詹國華表示，明道大學的「三加一」方案，類似交換學生的短期研修方案，目的是希望學校面對台灣「少子化」衝擊之下，開拓一條新的生源管道，陸生在台1年的交流時間，可以增加學校收入，從2012年開始，明道大學「三加一」方案，一共招收2057位陸生，如果不考慮中途休學、退學學生，以1名學生每學期10萬元學費計算，10年下來學校的收入是2億元，這些錢都有進到學校帳戶，沒有被掏空。
詹國華表示，「三加一」方案包括中國大陸的合作對象，都要經過教育部核准，若以《自由時報》報導，教育部在2014年到2016年發現相關帳務缺失，如果真的有重大掏空，教育部怎麼可能坐視不管？
校方坦言「三加一」方案帳務處理有疏失
不過，詹國華坦言，教育部在查核海外推廣教育業務時，對於明道「三加一」方案的帳務處理，的確有發現部分疏失，蠡澤公司這段期間，開給明道大學的單據，部分學費單據有誤開，或者是學費單據作廢沒有提供，導致單據「跳號」情況，教育部要求，明道既然在這段期間招收200個陸生，就要出具200張單據，且單據不得有「跳號」情形，蠡澤方面也配合教育部要求，把先前誤開跟作廢的單據提供給教育部。
另外，由於明道大學上海辦事處，係委託蠡澤公司代管，因此，蠡澤匯給明道大學的款項，係將「三加一」方案陸生學費，扣除掉代管費用後的「淨額」，教育部在2016年底稽核時，認定該校的海外推廣教育收入有未入帳，以及獎補助經費重覆核銷的問題。
教育部不認「互抵」 詹國華：差額510萬已匯回明道
詹國華解釋，明道大學過去一段時間跟教育部解釋，蠡澤當初匯給該校的款項，係「應收、應付款互抵之淨額」，這樣的帳務模式在旅行業十分普遍，不過，教育部方面仍然認為，「應收、應付款互抵」作法，違反《商業會計法》，要求明道大學補正交易。
詹國華表示，針對教育部要求，該校已於2018年1月30日，請蠡澤公司迴轉「應收、應付款互抵」交易，將差額510萬元匯給該校，教育部方面也已函覆明道，「校已追回該款項重新依約辦理核銷事宜進行改善，本部已悉……」。
詹國華表示，上述510萬元匯入後，明道大學仍有一筆同額的款項，必須支付給蠡澤，未來將待檢調釐清案情後，再付給蠡澤。
