移植爭議成為FDA的難題
糞便銀行的作用聽起來十分美好，不過在類似醫療服務的監管方面依然存在不少爭議。雖然在不少案例中，這種治療手段都顯示出良好的效果，但它的安全性和有效性還沒有在對照試驗中得到充分驗證。萬一處理不當，這種移植可能會導致新的感染，目前，美國食品藥品監督管理局（FDA）對糞菌移植的態度實際上是「睜一隻眼閉一隻眼」，如何對糞菌移植進行恰當的評估和監管，明確的管理規範至今尚未明確，也是未來要面臨的一大難題。
【小知識】何謂困難梭狀芽孢桿菌？
困難梭狀芽孢桿菌會造成胃腸道的感染，主要症狀是腹瀉，可能引發腹瀉、偽膜性大腸炎、毒性巨結腸等症狀，造成患者極度不適，嚴重的話將導致敗血症甚至危及生命，每年竟有高達1.4萬美國患者因此死亡。由於抗生素的抗藥問題已經越來越糟糕，雖然會殺光所有細菌，但也包括有益菌種，反而打亂體內平衡，這種腸道感染變得更加難治，復發率相對也高達20%，目前移植糞便中的腸道菌群是最理想的治療方法，成本比抗生素治療要低，可為每位病患平均節省1.7萬美元。
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