台灣農地違章工廠問題嚴重，具火災及環境汙染等隱憂，相關法源《工廠管理輔導法》（下簡稱《工輔法》）經歷幾次修改，卻仍無法解決此問題。儘管有號稱「《工輔法》2.0」的修正法案在2019年通過、2020年施行，但據民間團體估計，違章工廠仍從2019年的4萬5千家，擴增到最近的5萬4千家。
新建的即報即拆 既有的循序納管
2020年上路的「《工輔法》2.0」，針對違章工廠，有幾項處理方式。第一，對於2016年5月20日之後設立的農地違章工廠（法令中稱為「新增未登記工廠」），採取「即報即拆」、「斷水斷電」的措施。第二，針對該日期之前設立的農地違章工廠（法令中稱為「既有未登記工廠」），高汙染者輔導轉型、遷廠，否則斷水電、拆除；低汙染者，則可依循規範，由政府納管。
根據目前的《工輔法》，低汙染的既有未登記工廠，可在2年（2022年3月19日之前）內申請納管、3年內提出工廠改善計畫、10年內設法取得「特定工廠登記」，並於20年內完成地目變更，走向合法。
雖然並非直接無條件就地合法，但對於較早設立的低汙染違章工廠來說，這似乎仍是個轉型、合法化的好機會；然而，其實台灣這類工廠規模普遍較小，取得「特定工廠登記」由於須自費改善消防、環保及水利設施，對小業者仍具門檻，多數並不願意配合。
權責不明成本高 工廠拆遷大不易
2016年5月20日之後的「新建未登記工廠」，問題則更大。雖然新法訂定拆除法源，但2020年《工輔法》2.0上路至今，遭經濟部拆除的未登記工廠，卻僅有5家。未登記工廠的拆除，其實不容易，「誰來拆？」、「有沒有能力拆？」都是棘手問題。
一般來說，違建拆除多由地方政府建管單位處理，但《工輔法》的主管機關，在中央是經濟部，在地方則是各地的產業發展處、經濟發展局等，這些單位通常並不會被分配到拆除違章工廠的預算，且違章工廠數量多、擴增速度快，拆除成本極高。因此，在違建的拆除方面，違章工廠始終不會在第一順位。
除了拆除權責不明、成本不小之外，還有社會經濟結構的問題。其實台灣許多地區的農地工廠，都支持著地方的就業和經濟運作，當拆廠可能大幅影響民眾生計時，就變得更敏感、不易執行。
違建工廠問題大 政府卻疏於執法？
儘管有重重障礙，住展房屋網企研室仍須指出，在農地上違規新建工廠，一方面使土地使用更加混亂，另一方面，無法針對這類建物進行稽查、管理、拆除，也將帶來嚴重後果，有關單位不應再縱容更多違規工廠建造。
前面提到的嚴重後果，尤指火災。台灣不少工廠都會採用鐵皮建材，發生火災容易造成扭曲變形，使得搶救不易，過去就有許多消防員在鐵皮建物火場中喪命。住展房屋網企研室認為，針對這類須嚴加管理的建物，官方不該再持消極態度，應積極清點新建違建工廠，做出適當處置。
住展房屋網企研室指出，就算拆廠實際執行上有困難，依據法令，相關單位手上仍有斷水、斷電這項政策工具，法規訂出來，就不應疏於執法。農地工廠違建，已經是幾十年來累積的大問題，輔導既有工廠「合法化」的同時，也不能縱容違法工廠續建，持續增加問題。
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責任編輯/郭家宏
