人體的免疫系統主要分成：先天免疫力（innate immunity）及適應性免疫力（adaptive immunity），以及微生物免疫力（microbial immunity），好的微生物保護我們不受病原體侵害，但微生物彼此之間的交互作用動態且十分活躍，不時有新的細菌加入，可能經過不久後就消失，或者成功取代原本的細菌，因此保持體內生態平衡非常重要。
救命仙丹也是兩面刃：抗生素
自古以來，外科手術最大的難關，就是預防術後的微生物感染。古代醫生學會用酚劑、酒精等物質殺菌，但這些方法都不見得奏效，無數病患死於術後的化膿，直到1928年佛萊明發現青黴素，可說是為人類提供了全面擊退細菌的毀滅性武器，不只外科手術成功率得以大增，也讓腦膜炎、猩紅熱、膿腫、肺結核、梅毒這些古代絕症得以治癒。
抗生素的療效主要分成三大部分，一是攻擊細菌用來製造細胞壁的裝置，沒有細胞壁，細菌就無以維生。第二是抑制細菌製造維持生理功能的蛋白質（用以消化食物、建造細胞壁、繁殖及抵禦入侵者），最後一點則是抑制減緩其增生，讓人體有足夠的時間啟動免疫反應。
但隨著抗生素的使用日漸廣泛，甚至到了濫用的地步，許多副作用就出現了：有的是因為抗生素本身的毒性，輕則引起過敏、讓牙齒變黃變黑、損害聽神經，最嚴重甚至致死。而且不正確服用抗生素，也讓苟延殘喘的病原菌演化出抗藥性，這種百藥不侵的「超級細菌」，可能讓人類面臨無藥可用的窘境。抗生素曾經是照亮人類生命的一道曙光，但這種有如地圖炮式的濫殺，是壞是好，值得令人疑慮。
美國女子Peggy Lillis一次到牙科診所做治療，服用了牙科醫生為預防感染常開的藥物——克林達黴素（clindamycin），回家後嚴重腹瀉，後來送醫幾乎快要休克，檢查發現她體內嚴重感染了困難梭狀桿菌（clostridium difficult），滲透到身體各處出現敗血症狀。健康的腸道中也會有這種細菌，在好壞菌比例維持正常值時不會發生危害，但Peggy過去服用的抗生素大舉消滅益生細菌，讓困難梭狀桿菌有機可乘。最後不幸地，這位年僅56歲的女子還是走了。
針對嚴重感染，抗生素仍然非常重要，重要的是，我們不應任何小病都依賴抗生素，若需要服用，也必須謹遵醫囑，維持一定的藥物濃度，在最短時間內盡快抑制病原菌的勢力，然後恢復正常生活，讓體內微生物的分布恢復正常。
本文部分截取自八旗文化出版《不該被殺掉的微生物：濫用抗生素如何加速現代瘟疫的蔓延》
