魏姓民眾網購白色恐怖時期文件，引發憲兵濫搜爭議，國防部灰頭土臉補破網之餘，疑似早有整批一九九五年的解密檔案流出，根據《蘋果日報》報導，「再生.com」手上持有的相關文件至少上千份，包括孫立人、郭廷亮案、鹿窟基地案等等，合理推測這批或數批文件檔案早在文物市場流動多年，國防部要追究濫搜責任的同時，不能不問：當年下令執行銷毀任務的是誰？未依令銷毀而讓文件檔案流出的人又是誰？他們是出於故意還是無知？
檔案法之訂定遲至一九九九年，但在此之前，《二二八事件處理及賠償條例》於一九九五年立法，《戒嚴時期不當叛亂暨匪諜審判案件補償條例》在一九九八年立法，換言之，即使政府檔案未經確立處理原則，但有關轉型正義之真相保存和公開，已有社會共識，一九九五年是李登輝繼任總統後，接連換掉李煥、郝柏村兩位行政院長，任命連戰出任閣揆，自覺權力穩固「終於像個總統」的年代，許多湮沈的黑暗歷史，不但能討論甚至要求公開追究，包括當年各機關的「人二檔」，說法是全部銷毀，但照政府對檔案的無知無覺，很難講到底有多少件該銷毀而未銷毀，不該銷毀卻散落民間的情況。
釣魚台文件流落上海，愧對葉公超
隨便舉例，根據民進黨立委蔡適應的質詢，不但國防部檔案流失，外交部也有一件釣魚台文件流失，而且流失到上海，被公開展示。蔡適應問外交部長林永樂是否需要追查？林永樂的問答是：不需要，因為五０年代、六０年代的文件早就失效，連調查都不必調查！蔡適應認為這是國防部與外交部法律素養高低有異之故。
蔡適應說對了一半，外交國防兩部法律素養有異，但對檔案保存的基本認知卻是外交部遠遠不及國防部，國防部是用了奇笨的方法企圖追回檔案，外交部根本理都懶得理就讓釣魚台漂流到上海，這不是荒唐嗎？釣魚台主權爭議未解，
爭執三方無不從歷史源流出發聲張自己的主權，外交部丟失了文件檔案皮不痛肉不癢，簡直愧對外交部老前輩們！
國難期間出任外交部長的葉公超，畢生奔走，他最引以為傲的一件事，就是拖著拉著死活都把全部外交檔搬到台灣，包括清季總理事務衙門檔，國亡而檔案存，除了故宮寶貝，中華民國政府擁瑰寶而不自知，葉公超若知道他的徒子徒孫們竟把釣魚台（肯定還有其他檔案）給搞丟了，大概要再氣死一遍。
監察院不當銷檔，連追究都沒下文
外交部國防部之外，還有一個監察院，三年前該院前秘書長陳豐義指示辦理「監察院調查案件檔卷清理計畫」，讓監察院一千六百五十四卷的調查案卷內容不當銷毀，當時是檔案法早已公布實施，監察院腦袋裡彷彿沒這個法，莫名其妙銷掉一千六百多卷案卷，甚至連銷毀清冊都未列，結果如何？監察院彈劾自己的秘書長，結論是：本件停止審議程序。換言之，沒下文了。停止審議的彈劾案尚未結案，最近監察院準備「清倉」，這件不當銷毀檔案之案，順理成章再被「銷毀」一次。監察院如此，如何期待其他機關善待並保存應歸檔之國家文件？ （相關報導： 時代力量黨版不當黨產條例公布 制定吹哨者保護獎勵條款 ｜ 更多文章 ）
台灣經過三次政黨輪替，從李登輝到陳水扁，看不出他們為國家保存多少檔案？倒是拿不少政府檔案材料出自己的書，恍若未覺這些材料是國家資產，言及此，還不能不慶幸總統府至少還留下了兩蔣的「大溪檔案」，而兩蔣日記移到美國史丹佛大學胡佛研究所「暫存」五十年，讓兩蔣相關研究在這幾年中蓬勃發展，若真留在台灣，算不準幾年後會不會在拍賣市場現身。憲兵烏龍辦案，卻辦出台灣只在口頭追求轉型正義之可笑與可哀，真相從來不在兩蔣銅像身上，真相就在那些零落於角落的散頁。
