國民黨在基層選舉慘敗，2016接班人選問題浮上檯面。副總統吳敦義30日上午面對媒體詢問與新北市長朱立倫搭檔參選的可能性，直言「從沒動過這個念頭」。
九合一選舉隔日，馬英九總統及行政院長江宜樺都沒有公開行程，只有吳敦義照常出席公開活動，並回應馬英九請辭黨主席，及國民黨敗選原因等問題。
媒體問到國民黨在2016是否可能出現吳朱配，吳敦義直言「從來沒動過這個念頭」。他表示， 他是「一個鄉下人出身」，還是二二八事件白色恐怖的受難者家屬，自己受到國家栽培、人民愛護，有幸擔任縣長、直轄市長、立委、閣揆和副總統，已經超過自己原先規劃和想像，沒有計劃要競逐外界傳言的職務。
對於馬英九在投票日當晚並未表態辭去黨主席，吳敦義表示，國民黨遭遇重大挫敗，相信馬英九已慎重考慮過黨主席的職務辭或不辭的問題，「不辭比辭心裡要苦，肩膀上千斤萬斤的重擔要更重，蠟燭要兩頭燒」。
吳敦義說，馬英九若辭去黨主席，「一辭就了事」，但可能造成120年歷史的國民黨面臨不合黨章規定的問題。吳敦義說，依黨章規定，國民黨選出總統是當然黨主席，一旦辭黨主席，要由誰來接替？還要召開全代會修改黨章，這些都是馬英九心頭縈繞的重擔，「只要稍稍了解，就知道辭與不辭之間是千萬難」。
吳敦義說，他了解很多黨員有極大失望，也對黨愛深責切，身心都遭受非常大的心力交瘁的壓力。在接下來黨的改革方面，他希望馬英九在政的方面從事確確實實的改革，重新挽回人心；在黨的方面，思考加強黨的凝聚力，以及因應對新世代和網路世代的方法。
對於網路世代衝擊傳統選舉模式，吳敦義說，在這次選舉中，可以看出民調出乎預料，直到投票前夕封關之前，仍有很多民調指某些縣市勢均力敵而較受關注，「某些市領先二十幾趴」而較少警覺，這就是網路新世代的崛起，手機族已經不是傳統打電話做民調所能精準掌握。
他表示，國民黨未來不只要改革，還要充實這個欠缺的領域，傳統選戰方式也必須與時俱進，做非常明確迅速有效的改革。
