美中第一階段經貿協議可能將顛覆全球的貿易爭端解決方式，賦予美國比競爭對手更多的優勢，並弱化了國際機構的力量。
在經貿協議執行過程中，如果出現爭端，解決辦法通常是透過仲裁：某個國家或公司提出申訴後，由一個專家會議做出具有約束力的裁定。充當國際貿易法庭的世界貿易組織（WTO）便是使用這種模式。
但美國總統川普（Donald Trump）一直強烈抨擊這種方式，認為此類專家會議蠶食了美國的主權、不遵守貿易法。川普政府已透過阻止任命新法官來削弱WTO的爭端解決體系，並讓《美墨加協定》（USMCA）的仲裁體系弱於被其取代的北美自由貿易協定（NAFTA）的仲裁體系。
（編按：WTO上訴機構至少需要三名法官才能運轉，去年12月10日兩名法官正式結束任期，僅剩一名在任。但任命新法官需要164個會員一致同意，美國政府過去兩年來不斷提出異議，因此沒有新法官接替。）
參與相關討論的人士稱，美中貿易談判美方牽頭人、美國貿易代表萊特希澤（Robert Lighthizer）會見來訪的商業團體時曾表示：「我唯一信任的仲裁者是我自己。」
美中第一階段經貿協議下，爭端不會提交仲裁，而是將通過雙方的三輪談判來解決，且最終賦予美國在不滿意相關結果的情況下，得以加徵關稅的權利。
北京方面也有這一權利，但在該協議中，幾乎所有讓步都是中國做出的。這讓美國更有可能向中國施壓，要求中方執行其勉強同意的條款。如果美國採取行動，中國不能反制，甚至不能向WTO提出申訴，除非中國退出這項協議。
雪城大學（Syracuse University）中國貿易問題專家樂芙（Mary Love）表示：「這套新機制將是對WTO的強烈蔑視。」他還稱：「爭端裁決者將是與總統交流意見的貿易代表」。
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第一階段經貿協議的所有部分都受到這些執行條款的約束，包括採購、知識產權保護以及中國承諾不利用外匯政策來提振本國出口等等。若北京方面覺得美國不守信用，也不能排除中國反制的可能性，但根據協議，中國唯一的辦法是破壞協議。
北京方面幾乎沒有退出該協議、重燃貿易戰的動機。因此，美國認為中國不太可能採取反制措施。一名參與談判的美國高級官員說：「我認為，他們會認為留在協議中符合他們的利益。這套機制是為了避免他們反擊、報復或在WTO挑戰我們而設計的。」 （相關報導： 華爾街日報》中美貿易暫且休兵，台積電或難全身而退 ｜ 更多文章 ）
產業官員說，美光科技公司（Micron Technology Inc.MU）長期以來一直抱怨中國競爭對手試圖剽竊其半導體技術，該公司正在考慮使用這種新的爭端解決機制迫使北京方面停止其做法。但美光的情形與其他公司不同。該公司是少數將不滿公諸於世，還尋求政府援助的公司之一。去年9月，川普總統在聯合國大會上表示，美國正試圖為美光「伸張正義」。
