台北市長柯文哲2014年參選台北市長時，遭國民黨前立委羅淑蕾告發，因而涉入「MG149案」。台北地方法院檢查署6月將柯文哲不起訴處分後，依職權送台灣高等法院檢察署再議，15日高檢署也認定台北地檢署認事用法無誤，全案不起訴處分確定。
柯文哲在參選2014年台北市長時，羅淑蕾指控他在任職台大醫院外科加護病房主任時期，設立MG149專戶，接受葉克膜廠商和企業捐款，還另設「私帳」侵吞MG149經費，並用不實發票向廠商請款，涉嫌洗錢、收取廠商回扣和捐款等罪。但台北地檢署6月偵結，認為柯文哲涉嫌違反貪污治罪條例罪及犯刑法背信、詐欺取財、行使業務登載不實文書、公務員假借職務機會煽惑他人犯罪及違反商業會計法、稅捐稽徵法等罪嫌，均因罪嫌不足，予以「不起訴處分」。台北地檢署檢方隨後依職權送往高檢署再議，15日高檢署也認定台北地檢署詳實查證，認事用法並無違誤，駁回再議，全案不起訴處分確定。
北檢在調查後發現MG149帳戶包括公帳、私帳、個別帳，檢方認定MG149的「私帳」主要是幫助成員若是急需研究經費，可先由私帳取用，之後再把申請到的經費補回私帳即可。檢方查證後，並無發現有成員私吞款項。而柯文哲的妹妹台大眼科醫師柯美蘭雖然並非是柯文哲的團隊成員，但在私帳裡領取約8萬多做研究經費使用，不過最終將款項全數繳回，並無違法事宜。
