針對嘉義市國中小校長遴選爭議，有國小校長未通過連任遴選；也有家長會長控訴校長遴選制度不公，讓不適任校長繼續連任；嘉義市議會專題討論國中小校長遴選制度，議員張榮藏、黃秋澤、王美惠、鄭光宏、傅大偉、張秀華、陳幸枝、蔡永泉、李忠曆、蔡榮豐、蔡文旭等質疑嘉義市國中小校長遴選有可議處，張榮藏鼓勵未獲連任的校長循行政訴訟討公道。
市長涂醒哲強調，這次遴選可受公評，別泛政治化；教育處長余坤龍表示，嘉義市國中小校長遴選樣態不太一樣，但公平公正原則不變，本次遴委會15名委員，由市府代表、學者專家、家長代表、校長代表及教師代表組成，教育處尊重最終票選結果；獲遴選比例並非臨時動議，而是校長遴選會議的第一個議程，循往例均於會議中提出，由委員討論、共同決議。今年第一次校長遴選時，大多數委員均認為校長一職重要性高，需三分之二委員同意通過才獲遴選，因此最後達成此一決議。
市府強調，獲遴選比例是委員內部的規則，並非候選人努力之方向；希望候選人在遴選會中充分展現自身優勢，爭取委員認同；遴選委員會組成依國民教育法及嘉義市公立國民中小學校長遴選要點，人數為9至15人，由主管教育行政機關代表、學者專家代表、家長會代表(且其比例不得少於五分之一)、校長代表、教師代表所組成。市長涂醒哲上任後按其精神，已將行政機關代表比例下降，增加教師、家長比例，希望廣納各界意見。
市府指出，此次獲遴選比例雖有更動，然而無論是二分之一或三分之二制，委員是13人或15人，都不會改變選舉結果；其次，關於訪視委員報告是否納入評選成績，市府回應，按過往經驗，訪視委員報告分數落點多在同一帶，即使採用，也無明顯鑑別度，對遴選結果實無太大影響。
涂醒哲表示，校長遴選只有黑馬，絕無黑箱；校長由誰擔任？是否連任？不宜由市長、處長或議員決定，應由家長、教師、市府、學者組成委員會共議。現行機制及具體措施可再研議檢討，模式可以改進，但絕對沒有內定。
關於候用校長相關議題，教育處表示，104年校長遴選，民生國中即由候用校長脫穎而出獲選；今年校長遴選，嘉義國中候用校長亦在蘭潭國中校長遴選中獲選；遴選過程委員均有充分討論，然而最後投票結果並非討論得出的結果，而是各自投票，行使其獨立權力，最後按得票數決定是否通過遴選；校長遴選公開、公平、公正，6月23日將開始本年度第三次國中小校長遴選報名，歡迎符合資格之候選人爭取。
