北京關切《兩岸協議監督條例》立法進度，然而由於監察院人事案未完成表決，加上執政黨決定優先處理《自經區特別條例》，導致監督條例甚至無法排入立法院臨時會議程。陸委會官員透露，監督條例的延宕不僅影響貨貿談判進程，連陸委會擬妥的說帖也無用武之地。
兩岸經合會預訂8月召開，規劃討論貨貿協議先於服貿協議送審生效的可能性。然而中國海協會會長陳德銘日前在一場公開活動中表示，兩岸近期還將就貨貿協議繼續磋商，能否先於服貿協議生效，關鍵在於台灣要求先通過監督條例立法，「即使貨貿談得差不多了，是不是也要等監督條例？」
然而由於朝野交鋒重點集中在監院人事，加上議事一再受阻，《兩岸協議監督條例》遭到延宕，連馬英九總統也數度公開質疑，「學運時要求先立法再審查，現在不立法也不審查」。陸委會官員表示，為了使監督條例的審議能較順利進行，陸委會不僅接連在各地舉行座談和說明會，也備妥長篇說帖呈交行政院；然而由於草案根本排不進臨時會議程，因此只得到「依陸委會規劃推動即可」的消極回應。
由於監督條例的審議困難之一，在於朝野共有7個版本，整合不易，陸委會高層透露，在地方座談會場合中，有在野人士認為，由「被監督」的政府部門提出版本，要求「監督者」立法院全盤接受，不太可能順利通過；陸委會若希望監督條例能順利進行審議，或可考慮協調國民黨立院黨團提出整合版本，較容易被立法院接受。
而政院人士則強調，提出「政院版」是政府部門回應民意的職責，但「政院版」並非鐵板一塊，完全不能修改，重點是必須有機會在立法院討論；討論過程中有需要調整的內容，再經由立法院程序進行協調。
