教育部長蔣偉寧14日黯然請辭下台，此事件不僅暴露了學術界為充論文數量不擇手段的陋習，也讓誰推薦蔣偉寧擔任教育部長的質疑浮上檯面，相關人等紛紛撇清、走避。事實上，學界人士直言，長期以來，由前教育部長曾志朗、前中央大學校長劉兆漢和交通大學校長吳妍華所形成的三角聯盟主宰多所國立大學校長人事，之後因蔣偉寧接任教長，頻頻委任3人擔任國立大學校長遴選委員，更形成壟斷國立大學校長遴選的學閥作風，成為台灣高等教育的隱憂。
2000年政黨輪替，陳水扁就任總統，延攬擔任陽明大學校長的曾志朗出任教育部長，陽明大學校長出缺，由時任陽明大學副校長的吳妍華代理校長，一年後真除。
2008年，政黨再輪替，馬政府延攬曾任教育部長的曾志朗出任政務委員，而吳妍華陽明校長任期亦即將屆滿，交通大學校長展開遴選作業，時任政務委員的曾志朗出任交大校長遴選委員會召集人，在曾的主導下，吳妍華無縫接軌出任交大校長，同一年，吳妍華獲總統馬英九聘為國策顧問至今。今年3月太陽花學運爆發，吳妍華力挺馬政府，4月10日學運後吳妍華向執勤員警道歉說，「我們沒有把學生教好」，引發交大師生及校友反彈。
曾劉吳 聯合大學系統總校長輪流當
學界人士檢舉指出，曾志朗、劉兆漢和吳妍華輪流擔任台灣聯合大學系統（中央、清華、交通、陽明4所大學）總校長，如同大風吹一般，聯合大學系統曾任總校長，由劉兆漢從2003年至2006年擔任，劉卸任後接任曾志朗的中研院副院長職缺；聯合大學第2任總校長由時任陽明大學校長的曾志朗兼任，直至2008年曾志朗擔任政務委員；此時第3任總校長由接任曾志朗擔任陽明大學校長的吳妍華接手，吳妍華不僅從曾志朗手中接掌了陽明大學，也接下了聯合大學總校長的兼職；2012年曾志朗卸任政委，再回任聯合大學第4任總校長。
學界人士指出，從2003年央大、清大、交大和陽明4校組成台灣聯合大學系統後，10餘年來這4校的太上皇「總校長」，都是由劉兆漢、曾志朗和吳妍華3人輪流接手，從未假手他人，依據相關規定，聯合大學總校長人選需報教育部核准才聘任。
綠委質疑蔣偉寧為學閥圍事
尤有甚者，當時擔任教育委員會召集人的民進黨立委邱志偉在2013年底的委員會質詢時，就曾質疑教育部長蔣偉寧此一獨鍾曾志朗的國立大學校長疑似特定人圍事情況。他指出，從101和102年度的統計來看，有17所國立大學辦理校長遴選作業，曾志朗就擔任了5所大學的部派遴選委員，且不只曾志朗，2012年中央大學校長遴選委員會中，劉兆漢是委員會召集人，吳妍華是委員；2012年台大校長遴選委員會中，曾志朗和劉兆漢同為教育部的部派遴選委員；2013年清大校長遴選委員會中，曾志朗、劉兆漢再次同為教育部部派遴選委員。
邱志偉指出蔣偉寧讓曾志朗身兼台灣聯合大學系統總校長，又同時是多所國立大學遴選校長部派遴選委員的情況，過於偏頗。蔣偉寧則強調，曾志朗的總校長職務只是兼職，目的在溝通、協調4校合作，位階並未比4校校長高。但不可諱言，當蔣偉寧在教長任內頻頻聘任曾志朗同時擔任聯合大學系統校長的部派遴選委員時，則曾對國立大學的強大影響力不言可喻。
