攸關地方政府財政問題的《財政收支劃分法》預計農曆年後出爐，據了解，因應六都升格，馬政府任內將直轄市勞健保補助部分自101年7月起改由中央全額負擔，中央因此增加710億元支出，六都在財源分配上已相對「佔便宜」，為了避免統籌分配款大餅增加千億後，六都分到更多，行政院準備從中央政府補助款中，扣除六都升格的勞健保支出減少的「影響數」，換言之，六都在《財劃法》修法，恐將無法享受到任何好處。
近年地方財政持續惡化，苗栗縣財政已被393公民平台評為「腦死」等級，其他包括宜蘭、屏東、雲林、花蓮等縣市的財政也亮紅燈，新竹縣則自去年9月起發不出敬老津貼，各縣市政府都在等待修改《財劃法》，提高一般統籌分配稅款分配金額。
地方政府舉債金額日益擴大 年增近千億
根據財政部規劃，過去幾年地方政府每年新增負債金額大約是800-1000億元，馬政府《財劃法》修正案，原本規劃統籌分配款部分增加1000億元規模，中央政府補助款維持不變，但民進黨政府並不認同。
根據財政部統計，105年度中央統籌分配稅款金額為2591億元，主計總處的中央政府補助款則有近3000億元，二者合計佔地方政府歲入至少2成以上，但由於近年多數縣市自有財源占歲出比率在5成以下，導致縣市政府舉債金額不斷膨脹，馬政府時期，地方政府的負債金額每年成長幅度高達800-1000億元，為解決地方債務問題，當時財政部規劃的《財劃法》版本，即規劃將中央統籌分配稅款規模增加1000億元，主計總處每年補助地方政府的中央補助款規模則維持不變。
統籌稅款增千億 主要來自營業稅
行政院官員表示，統籌稅款預計增加的1000億元部分主要來自於營業稅，營業稅在精省後改為國稅，過往每每成為中央與地方爭議焦點，尤其在高雄氣爆事件後，更成為高雄市長陳菊砲打中央的理由，因此本次《財劃法》修法版本，營業稅提撥至統籌分配稅款的提撥率將由40%調升至100%，因應營業稅的提高，為鼓勵地方政府招商，所得稅的部分提撥比率從10%降為6%，另外，直轄市的土增稅部分，過去係全額進入市庫，未來將比照縣市政府土增稅，提撥20%入統籌稅款。
六都分配統籌稅款600億 將扣除勞健保補助
不過，統籌分配稅款增加1000億元，按目前分配公式，六都仍可分到600億元左右財源，其他16縣市只分到400億元，對於過去幾年每年舉債上百億元的縣市政府來說，沒有具體財政改善的效果。為了解決高雄氣爆事件以來「污染在地方、稅收在中央」的結構性問題，統籌稅款分配公式將在人口、土地面積等參數以外，增加人口老化、污染回饋等指標，在縣市財政努力度部分，則將訂定招商獎勵指標。
行政院政務委員許璋瑤表示，台北市因為設籍的企業較多，當時中央政府以「投保單位」為計算基礎，台北市政府因此需要負擔360萬勞工及眷屬的勞健保費，台北市政府在扁政府時代，不服這項規定提起行政訴訟，後來六都升格，都面臨勞健保保費支出金額大幅增加問題，馬政府任內修改勞保與健保條例，六都自101年7月起，所有勞健保補助改由中央政府負擔。
六都勞健保補助 中央去年負擔710億
換言之，六都從101年7月起，每年因為勞健保支出改由中央負擔，財政負擔減少了6、700億元，去年六都的勞健保補助金額達710億元。
有鑒於六都因為勞保條例與健保條例的修法，財政獲得相對改善，中央政府準備在這次《財劃法》修法中，將六都勞健保補助列為影響數，未來統籌分配稅款大餅增加1000億元以後，六都雖然可以分到600億元，但中央政府會從中央政府補助款中扣除710億元的補助款。
在這一場勞健保補助爭議中，台北市可稱為最大苦主，前總統府副秘書長羅智強日前在臉書上，對於台北市長柯文哲自詡任內還清了154.8億的勞健保欠款，幫「前朝」收爛攤子為例。羅智強強調，事實上是馬政府在100年修法通過，勞健保補助（包括設籍勞工）完全由中央政府負擔，為柯市府省下228億。郝市府任內也為台北市非設籍勞工償還404億元。
勞健保欠款 台北已還清 高雄預計2022年還完
相較之下，中央政府對於高雄市的勞健保欠費，則給予相對優待，民進黨上台後，行政院針對高雄市政府勞健保欠款召開跨部會協調會，強調「不再區分設籍、非設籍，並在協助台北市金額不變前提下，修正為以勞健保應繳納數為計算基礎，同基礎同比率補助高雄市。」
依據北市欠款期間，中央補助比率21.9%，對於高雄市應繳勞健保欠款金額793億元，依同比率計算再增加補助高雄市124億元。124億元補助預計2022年還完，新北欠費118億部分，則已在去年還完。
根據前財政部次長徐仁輝所做研究，六都升格後，中央在升格第一年對六都的一般性補助與專案補助，雖然較前一年度增加400億元，但六都的支出也因為教育、社福等業務移撥，膨脹了近300億元，六都升格後所獲得的中央補助增加金額「實屬有限」。
