為什麼小農鮮乳總是比較貴？獨立酪農從收購鮮乳、委託加工廠、冷鏈配送，再到通路與市場行銷，每個環節都沒有大廠的既有生產工具與規模優勢，難以壓低成本，才會導致最終售價與大廠相差高達5%以上。
小農知名度最高品牌「鮮乳坊」一瓶936毫升定價120元，比起鮮乳市佔第一的統一瑞穗鮮乳建議售價92元，整整多了3成。在路易莎咖啡店一杯中杯拿鐵不過70元，換小農乳源就要加10元。根據凱度消費者指數2021年第三季市售鮮乳售價，小農鮮乳價位落在每公升87元，比整體鮮乳平均高出7元，相當9%的價差。
明明都是鮮乳，為何「小農」總是比別人貴上幾個銅板？其實，獨立酪農從生產端的養牛成本、加工廠、冷鏈配送，再到通路與市場行銷，各環節因為沒有大公司的事業基礎，成本堆疊起來相當可觀，才會讓終端售價更高。
困境1：獨立酪農牧場難以量產與彈性處理 特色化飼養都是錢
小農，顧名思義牧場規模不大，如果不與乳品大廠契約合作，國內多數酪農都會將生乳賣給代工廠或與鮮乳坊、台灣牧場這些專門扶持在地酪農的業者合作簽約。而因為沒有自己的加工生產線與銷售渠道，因此在牧場生產上無法盡情擴張。
一位與統一企業合作的酪農戶透露，跟大廠簽約3～5年的酪農戶通常可談到全量契作（買斷），因此不用擔心生乳產量多過合約，因為大廠一定都會全部收購。然而，若只是簽約一年、之後想獨立運作的酪農戶，就只能以固定的量談合約，因此，小農不僅多產乳不一定會有相應獎勵，冬天也面臨生乳滯銷的話，等於整體收入更不穩定。彰化縣農業處畜產科科長許天耀也說：「小農發展有一定的限制，畢竟不如大廠有這麼多的資源、事業體，可以彈性處理生乳，」
代工鮮乳坊8成生乳的中華民國農會台農鮮乳廠也承認：「小農發展得再好也有極限值，無法大規模發展。」台農代工的牧場生乳，單日收乳量約370公噸，若有酪農有剩乳會收到400公噸，台農會再拿這30公噸拿去做自家的鮮乳。
除了無法量體化，小農品牌與大廠最大的差異化在於，單一乳源與在地特色。而為了做出自家特色，不管是在飼料、飼養方式的優化上，經常需要額外成本。統一某契作酪農也證實，據他了解某知名小農品牌收購單一乳源鮮乳時，價格每公斤會比大廠加2元，A2鮮乳的乳源也是多2元，不僅是考量到為了更高品質所需投入的人力、飼料與硬體成本，同時也是鼓勵農民持續精進牛隻飼養的技術與效率。與6個牧場合作的鮮乳坊（慕渴股份有限公司）創辦人龔建嘉也透露，他們的生乳收購價比一般大廠高了10%左右。
