今年3月下旬，台灣虎航從泰國載感染麻疹返台的旅客，該旅客又搭機前往日本沖繩，使得後續發生職場麻疹群聚感染事件，共有8名員工確診，相關接觸人數逾4000人，引發全台恐慌。衛福部疾管署經2個月的調查後發現，台灣虎航從知情到通知機組員進行健康管理，整整「慢了3天」, 虎航未確實配合防疫作業，違反《傳染病防治法》，被處以5萬元罰款，此為衛福部對航空公司開罰首例。台灣虎航回應表示，將在最短的時間內提出訴願。
根據《傳染病防治法》規定，主管機關得對入、出境人員、運輸工具所有人及管理人等，施行不同防疫、檢疫措施，換句話說，國際航空公司自有配合並遵守主管機關施行防疫、檢疫相關規定的義務，否則可處以1萬元至15萬元罰鍰。
根據疾管署裁處書內容，經調查，台灣虎航在3月26日接獲疾管署「航空器傳染病接觸者航艙資料申請」，雖然其配合提供指標病例接觸者航艙資料，但未依指示要求與指標病例同航班機組員自主健康管理，且未由職安人員或指定人員執行接觸者健康管理追蹤，遲至疾管署29日通知，才被動轉發通知給接觸員工，屬於「應作為而不作為」的態樣，已違反《傳染病防治法》規定。
另外，台灣虎航從知情到通知機組員工進行健康管理，整整延遲了3天，此項違規更造成疫情後續蔓延。不僅虎航8名員工感染，並且波及到馬來西亞、長榮航空地勤，相關接觸者追蹤管理人數高達4000多人、創下10年來的新高。
不過，疾管署副署長羅一鈞指出，考量經疾管署監督輔導後，台灣虎航後續有協助進一步防疫、逐步落實各項防疫工作，包含接觸者追管、病假規定鬆綁、航空器每日消毒，以及鼓勵空服員麻疹、腮腺炎、德國麻疹混合疫苗（MMR）接種率高達98%，使該群聚事件自4月20日起未再確診新個案，因此開罰5萬元。
關於MMR疫苗的供應情況，原廠已確認約有15萬劑，將於5月30日運抵台灣，衛福部會儘速協助審查封緘作業，可望於6月中旬陸續放行，逐步恢復疫苗供應，以滿足民眾接種需求。
