潘鳴嘯的學術貢獻不僅止於上山下鄉研究，他也藉香港中西文化交流之便，於1991年在香港創立由法國外交部文化司資助的「法國當代中國研究中心」（CEFC），並曾擔任學術期刊《神州展望》（China Perspective）的總編輯，共有法文版、英文版，建立當代中國研究的學術交流平台。
1990年代，潘鳴嘯長住香港，見證香港面臨1997年主權移交中國的不確定感。《神州展望》研究當代中國，難免與中共的觀點不同。1996年編輯團隊開會，許多漢學家都感到悲觀，覺得法國當代中國研究中心在香港回歸中國後，不可能留在香港。但潘鳴嘯成功說服同事：「我們應該試著留在香港，不僅有可能成功，也是我們的責任！我們應該支持香港人，讓他們有機會保留國際城市的形式。」果然，潘鳴嘯領導的《神州展望》安然度過97大限，至今仍持續出刊。
潘鳴嘯憂中國「民眾沒有歷史教訓，很容易被利用」
研究知青成果豐碩的潘鳴嘯，目前把研究焦點轉向文革一代人的民間記憶。舉凡民間活動、刊物、書籍，都是他的研究題材。此外，潘鳴嘯也在香港中文大學擔任客座教授，開設「文化大革命」專題課程，親身與中國學生接觸，讓他對中國集體對歷史失憶的現象有感而發。
「中國的問題就是完全沒有記憶。」潘鳴嘯說，他的課堂上，大部分學生是中國人，有學生在學期最後一刻來找他，說：「謝謝老師，你給我們講了太多我們不知道的事，改變了我們的思想。」潘鳴嘯認為，若一個國家沒有歷史記憶，僅憑領導階層就可控制記憶，讓民眾失憶，會讓國家更加危險。「民眾沒有歷史的教訓，很容易被利用。」
曾對香港特首普選樂觀 潘鳴嘯嘆優秀青年外流
談到熱愛的香港，潘鳴嘯難掩擔憂，稱：「香港的問題令我感到悲哀」。1997年後，潘鳴嘯覺得那時香港仍有希望，有機會維持一國兩制。2007年，香港要推2017年香港特首全面普選，他也樂觀其成，沒想到中共2014年的政改方案，卻要特首候選人先過「提名委員會」的關卡，先選擇2、3個人，才讓香港人普選，激起香港人「我要真普選」的呼聲，同年9月至12月更爆發雨傘運動。
「我覺得這對香港人來說是一種侮辱。」潘鳴嘯說，北京的態度沒有變化，雨傘運動就沒有希望。「可是這不是希望、不希望的問題，你要表示你存在，你不得不表示不滿。」他認為，雖然不一定會有希望，至少要表達不同的意見。
潘鳴嘯憂心，如果中國政府繼續忽視香港的自由願望，或至少自治的願望，「結果會有很多人離開香港，特別是那些最優秀的青年，因為對未來沒有希望。」他說：「我希望不會如此，可是我發現這個現象已經開始了。」
