共濟會遠古起源有多種說法，但有正式記載的最早出現於1717年的英國。是年6月24日，英格蘭四個會所的首腦在倫敦聖保羅大教堂附近成立了第一個總會所（Grand Lodge），史稱近代共濟會運動的開端。
歷史機遇把遠古的石匠結社變性為「精神石匠」（即帶有社會改革使命色彩）的政治社團組織，成員主要是貴族和社會精英。英國18世紀喬治王和愛德華時代，王室和共濟會關係良好，不少王室成員加入了共濟會，包括喬治三世，還有詩人彭斯、王爾德，政治領袖丘吉爾、基普林等。
隨著大英帝國的興起，共濟會從英國向歐洲、亞洲和世界各地擴展，各國先後都成立了總會所，而且越來越多參與社會、政治和思想活動。歐洲啟蒙運動中的著名思想家伏爾泰、孟德斯鳩、狄德羅等都是共濟會成員。
美國獨立戰爭的發起人中有不少是共濟會成員。確認的共濟會成員包括開國元勳華盛頓、弗蘭克林，還有《獨立宣言》56名簽署人中至少8名，歷屆美國總統裏至少15名。
19世紀，美國許多銀行家、法官、富商和政客是共濟會成員，是精英圈的組織。歷經興衰，到1950年代後期重新振作，現在有會員大約400萬，佔全球會員總數的六成。
共濟會在清朝隨英國商貿進入中國，乾隆年間（1767年）英格蘭總會在廣州開設分會，但不吸收華人會員。甲午戰爭後，菲律賓共濟總會下屬的分會吸收了大量華人會員，1949年3月中國美生總會（Grand Lodge of China）在上海成立。
資料顯示，1949年後，中國共產黨政府禁止共濟會在內地開展活動，但香港共濟會不受限制。最早在香港加入共濟會的包括香港首任華人立法局會員何啟爵士及其繼任者韋玉爵士。
台灣最著名的共濟會員或許就是蔣緯國，曾任美生中國總會會長。
陰謀論
共濟會從誕生起就一直遭到質疑和反對。歷史上最著名的包括天主教會與共濟會幾個世紀的戰爭。起源是法國大革命時期共濟會被懷疑支持倒皇派。
丹．布朗的小說《達芬奇密碼》和同名好萊塢電影及取材於此，但被批評者稱陰謀論色彩濃厚，即便是虛構。
美國19世紀中發生摩根事件，引發草根階層的反共濟會運動，與當時的反傑克遜總統運動結合，抨擊主要成員是政商界精英的美國共濟會。
俄國20世紀初出版了一本書，《錫安長老會紀要》，最早將共濟會與猶太人聯繫在一起。
時至今日，關於共濟會財力雄厚，政界勢力龐大，秘密操縱世界的說法仍有相當的聽眾。
2018年2月初，據悉倫敦西敏寺議會大廈內新成立了兩個會所。
英國總會會長斯戴普博士承認議會大廈裏內有兩個會所，但成員裏不包括國會議員或負責報道議會消息的政治事務記者。
他不同意把共濟會稱作隱秘組織，也堅決否認普遍認為的共濟會員在職場、官場搞裙帶風和貪腐。
那麼那個傳說中的 秘密握手方式呢？BBC電視節目問他。
他說那根本不是秘密，但是不能演示給你們看，因為他保證不向公眾演示這個圈內人之間的握手方式 。
那是不是暗號呢？他沒說。
