據了解，為防範中共對台猝然突襲甚至進行斬首行動，國防部長馮世寬已要求，重要軍政、軍令高層如部長和參謀總長，除因重大演訓或總統視導部隊等特殊情況下，非必要時應避免在國防部外同時公開現身，這項政策並已從今年初開始落實；而軍方也早有規定，國防部長和參謀總長不得同車或同機。
軍方高階官員外出 分軍政、軍令系統行動
對此馮世寬曾表示，主因顧及國軍衡山指揮所必須有高層留守監控當面敵情、怕臨時有狀況，所以他和總長邱國正已避免出現在同一場合；另有軍方高層則證實，軍方高階官員外出時，今年起已分為軍政和軍令系統兩組人馬，背後和安全考量有關。
為防範共軍對台進行斬首戰，其實早在扁政府時代國安和軍方部門就已開始警覺和因應，其中在2005年「玉山政軍兵推」的想定中，就曾模擬共軍趁當時的陳水扁總統出訪期間，對台發動猝然攻擊，並進行斬首行動，推演想定劇本中，時任國防部長李傑在戰時遇襲身亡，改由參謀總長李天羽接任部長繼續指揮作戰，當時還傳出李傑對於國安會擬定的劇本極度不滿，並要求更改國防部長遇襲的假想情節。
曾模擬李傑、蘇貞昌遇襲 考驗戰時應變
後來李天羽實際升任國防部長後，在立院被問到當時兵推狀況時證實說，「確實是有這樣的一個狀況的推演，各部會的首長，重要的這些首長，非常可能遭受到這些傷害。」 而當年模擬推演的想定內容，除國防部長李傑在戰時遭到不測，連時任行政院長蘇貞昌都假想遭到共軍襲擊，藉以考驗政府各部門的戰時是否能繼續運作和有效應變。
軍方指出，為避免軍事中樞遭襲擊後頓失指揮能力，國軍近年來在硬體上各軍種都已備妥第二、第三指揮所，指管通情系統也建立「異地備援」能力，隨時可從轉移戰時的軍令指揮陣地，今年漢光演習也會持續驗證戰力保存能力。
黑鷹UH-60M型、S-70C型直昇機 空降國防部模擬運送
今年2月中軍方就曾出動黑鷹UH-60M型和S-70C型直昇機各一架，首度演練空降國防部前，模擬戰時運送特戰部隊兵力強化國防部和衡山指揮所的防護，同時搭載分組後的政軍高層分散到其他備用指揮所，以避免遭到斬首攻擊後，國軍作戰指揮群龍無首。
軍方高層指出，現在除非是在國防部內，或是陪同三軍統帥的重要視導行程，或像是漢光演習等重大演訓，否則部長和總長外出時已不曾同時現身，就算是巡視部隊，通常部長會帶著政戰局長、常務次長等軍政系統官員為一組，另總長若有外出行程，則和軍令系統官員另分一組。
軍政、軍令系統分開 維持衡山指揮所有效運作
高層官員說，過去在基層部隊，正、副主官管都會有明確代理人制度，像是休假和戰備留守都會分成兩組，但在軍方高層卻一直沒有類似做法，因此馮世寬部長才會要求軍政和軍令系統分開，背後當然和安全考量也有關係，但並非是完全針對共軍所謂的斬首行動，主要還是為了維持國防部和衡山指揮所有效運作，像先前共機和航母繞台，不能有狀況時沒有高層在衡山指揮所內坐鎮。
國防部內防護嚴 部長、總長仍會同時出現
至於今年過年蔡英文總統到國防部出席春節餐會，仍見到國防部長馮世寬和參謀總長邱國正同台現身，高層官員說，如果是在國防部內，有一定的安全維護，就沒有這項顧忌，召開會議時部長和總長當然也要同時出席，這項規定僅止於參與部外活動時，例如一些拜會或餐敘活動，軍政和軍令首長盡量避免同時出席，馮世寬甚至已要求參謀本部聯參將領不用再參與相關活動，部外活動都改由軍政官員代表出席，軍令官員則專心看好國軍衡山指揮所。
