自二千多年前希波克拉底寫下標題這句話以來，人類就一直試圖透過所吃的食物來促進健康，但成效不彰。在1941年第二次世界大戰期間，英國首度發表做為公共衛生措施的正式飲食建議，八十年之後，我們的現代社會則由於高脂肪、高糖分的飲食，而被肥胖、糖尿病和高血壓所困擾，事實上，這三者的結合被稱為「代謝症候群」。
在英國，五十歲以上的人中，有多達三分之一受到代謝症候群影響。幾千年來，包括在歐洲咀嚼瀝青的狩獵採集者時代，腸道微生物群系在定期接觸各種植物和動物微生物的條件下進化，而這些微生物在今天的加工食品鏈中已不復存在。現代食品與古代飲食有很大不同，我們的腸道微生物群系也是如此。
科學發現，我們吃下的食物類型不僅改變了腸道細菌的數量，也改變了牠們的多樣性、化學性質，以及牠們與宿主身體（我們）的關係，從而影響我們的健康，甚至根據我們將要吃進肚裡的東西，來預測腸道微生物的變化，也是有可能的。更令人吃驚的是，兩個不同的人由於腸道微生物的差異，吃了完全相同的食物後，也會產生相反的影響。這是不是很違背常理和反直覺？別的東西先不提，這解釋了為什麼同樣的飲食可使某些人體重減輕，卻會使另一些人的體重增加。
食品加工是避免身體營養不良的一種值得稱讚的嘗試，它使食物中的營養素對我們的小腸具有高度的「生體可用率」（bio-available），但這樣做會使我們的腸道微生物群系挨餓，而大部分腸道微生物群系存在於大腸中。加工食品包括任何經過改良以保存營養成分並添加維生素、礦物質的東西，而且會使用任何保存方法。
基本上，我們每天購買和食用的食物大部分是「加工過的」，從玉米片、粗鹽醃牛肉（cornedbeef）到咖哩都是。食物保存的好處之一是它可抵消新鮮食物中營養素通常很短的「半衰期」（half-life）—指營養素在血液中的含量下降一半所需的時間，許多新鮮食物在收成後一轉眼就腐爛，但食品加工通常會提煉出生體可用率低的成分，如纖維。
因此，一旦這類食物通過小腸，留給我們腸道細菌的食物就變得寥寥無幾了。結果不僅是體重增加和肥胖，腸道菌叢也會減少。簡而言之，高生體可用率會造成肥胖的身體和飢餓的腸道，而低生體可用率則能打造輕盈體態和健康腸道。我們需要翻轉我們的現代食物模式，回到古老的模式，從而恢復低生體可用率和其培育出的古老細菌好朋友。
我們該怎麼樣才能辦到這點呢？實現微生物健康飲食的原則非常簡單且容易遵循：
● 我們攝取的食物種類愈多愈好，食物種類繁多代表腸道微生物多樣性會更高，反之，發炎程度和體重都會更低。多樣化的微菌叢會產生更多的神經傳導物質和荷爾蒙，降低身體壓力系統的壓力，並有助維持大腦中的穩定狀態（體內恆定homeostasis）。
