獵雷艦案引起政壇風暴後，海軍司令黃曙光下令，包括會議錄音等獵雷艦相關資料要嚴加管制，目的是為了防範重演二十四年前尹清楓案發後，許多重要證據神祕消失。
一九九三年十二月十日，宜蘭縣蘇澳漁民撈起海軍總司令部武器系統獲得管理室（武獲室）執行長尹清楓上校遺體，頓時引爆軍中危機。
當年尹清楓的喪生也是因為獵雷艦採購案，尹案爆發，讓眾多軍官、軍火商入獄、被處分或流亡海外。二十四年來，「尹清楓」幾乎已成了軍購弊案的代名詞。到底尹清楓案的來龍去脈為何？與今天的獵雷艦案有何不同？
誰謀殺了海軍上校？
尹清楓究竟為何而死？軍火採購利益分配問題是主因。這一點郭力恆（海軍武獲室前上校組長）應訊時也證實。目前可知，獵雷艦的採購案是這件謀殺案的一部分，並非全部。至於尹清楓是因為清白耿直、擋人財路而被殺？還是本身也與軍火商有利益糾葛？則有待進一步釐清。
獵雷艦的採購極機密，這個採購案從民國七十二、三年就開始在談。由於海軍嚴禁有代理商介入這項採購案，因此，當稍後傳說有一家闡氏公司介入該項採購時，國防部毅然停止該項採購，時間長達一年多。
後來國防部再查證代理商已經不在了，於是再度進行，國防部並跟德國強調，中間不能有代理商，否則視同違約。當時建案是買四艘，最後透過中油的名義買成，賣給我方的廠商是Ａ＆Ｒ廠，但這件事後來被德國政府得知，該廠違反商品輸出法出口許可被取消，於是該廠就以變相漲價的方式，來讓我方購買零附件的企圖打消，他們零附件的金額由先漲一八％再漲到三○％，我方無法忍受，便祇好另覓廠商購買。唯一的條件是，必須能取得出口許可。
後來德國Ｌ廠便出面跟海軍簽約，當時是民國八十一年，合約到八十三年五月為止，合約內容大約是四億台幣，八十一年九月海軍先簽下兩千兩百萬馬克，至今還有後續的一千七百萬合約尚未簽訂。原本這個零附件的採購應該沒有問題，但後來由於製造水下遙控除雷載具的德國ＳＴＭ廠突然被收回輸出許可，這下子讓Ｌ廠的代理業務少了極重要的一項，而這一項等於是獵雷艦最重要的部分。當時，傳出的消息就是張姓代理商代表ＳＴＭ廠和海軍接觸，而且有部分的現役軍官跟他們有接觸，沒多久，海軍總部就收到黑函，指稱郭力恆和尹清楓入股到張姓代理商這家公司，政三處也曾加以瞭解。
這件事，後來引起尹清楓和涂太太（台灣旅德軍火代理涂鄭春菊，當時代表德國Ｌ廠）之間的衝突，尹認為涂寫黑函抹黑他，而涂則矢口否認，涂太太也曾找張姓代理商對質，問他是否真的代理ＳＴＭ廠的零附件，張說沒有。
九日早上，郭力恆曾向尹清楓說：「他們在等，要來抓人了。」意思即是軍火商要來找他們談。如果尹最後果真去赴軍火商的約，那這幾位與獵雷艦零附件採購有關的軍火商，就必須詳加調查了。
不過，據調查單位透露，尹清楓的死，絕對不是獵雷艦零附件採購這麼單純。在其他的採購中，因為尹清楓的地位很重要，因此，成為廠商爭相籠絡或者甚至排除的目標。
一位海軍總部高層將領透露，尹清楓到武獲室的時間很短，但是由武獲室退伍出去的軍火商不少，甚至有些現役軍官跟這些軍火商的關係密切，他們懷疑尹清楓這位初生之犢很可能擋了別人財路，而慘遭毒手。（摘錄自三五五期【封面故事】，邱銘輝撰文）
軍官和軍火商掛鉤不少，但總司令都不知道
才風風光光成立的海軍總部武器系統獲得管理室，最近因其上校副主任兼執行長尹清楓的離奇死亡才廣受注目。雖然有很多軍官想進這個主控海軍重大採購案的熱門單位，但據一位剛從武獲室申請調職轉任的校級軍官說，該單位確實油水多，但也因此鬥爭激烈。得勢者呼風喚雨吃香喝辣；不得志者苦不堪言盡想脫身，一般是考試轉任或期滿就退。
「裡面很黑暗、內幕見不得人」、「想脫離卻出不來很痛苦」、「單位內外軍官和軍火商掛鉤不少，但總司令都不知道」……，雖然已經離開，但他至今談及武獲室時，似仍心有餘悸，且憤意難消。
他先以七○查理──空中預警反潛機「神鷹專案」採購計畫為例，承辦人員除了要飽嘗來自軍火商、掮客、民代、返職將領的各方壓力外，還得提防武獲室內部部分同僚的傾軋鬥爭與暗算，那才是最難忍受的。
「所以尹清楓生前對太太說『身邊有人要害我』的那種心境，我是感同身受、心有戚戚焉！」他語氣沉重的說。
另外，如最近被掀出來的海測船採購案，他也透露該案好處不但由某現職將領一手遮天大口獨吞，而且還有一位曾任海測局主官的姚姓退役將軍介入想分羹；連武獲室主任李崑材都插不上手。
至於獵雷艦及零組件採購案內幕，雖有人向軍法處甚至總統府檢舉，但政三監察以「查無實據」結案。要不是尹遇害，又有誰知道真相？
他指武獲室內部壓力除了來自敏感任務，還有利益之爭，加上為了搶位子，若有人使出「出資、分贓手段，都不稀奇！」（摘錄自三五五期【封面故事】，楊和倫撰文）
案發百日，尹案漸成懸案
案發剛滿百日的尹清楓命案會不會變成隱案？甚至變成懸案？現在已經成為社會大眾最關注的話題。由於刑事局專案小組的臨門一腳，已經讓外界等待太久，尹案變成懸案的可能性也相對大增。
一位專案小組的核心人物私下表示，除非有奇蹟出現，否則這個案子還真是難破。因為該查的線索他們幾乎都去查過，關係人也一個個過濾過，但是一般命案都會有一定的軌跡，而這個案子卻沒有。
軍方移送給警方的命案關係人分別是張可文中校、郭力恆上校、軍火商劉樞、祝本立與張家成，軍方把這幾個人移送的原因，就是表示這幾個人有嫌疑。軍方最早是鎖定郭力恆，因為他是最後與尹清楓連絡的人；後來警方透過通聯紀錄，發現郭力恆當時並沒有充分時間參與殺害尹清楓，於是偵查方向首度大轉彎，目標轉向劉樞。
劉樞的供詞出現許多破綻，而且他還假造許多不在場證明，事後一一被拆穿，但是最關鍵的尹清楓遇害時間，他卻有通聯紀錄證明，當時他正和女友在電話上情話綿綿，根本不可能去殺害尹清楓。
郭、劉兩人直接涉案的可能性大減之後，專案小組內部已經出現第三種聲音：「兇手可能還未浮上檯面」，持這個意見的人已經逐漸增加。假如真是如此，那要偵破尹案，可能還真有一段路要走。
據瞭解，假如短期內命案再沒有突破，專案小組將找偵辦洩密與行賄的專案小組成員一起開一個檢討會，重新檢討是否有遺漏的線索需要補查證。在此同時，刑事局專案小組也將會整理出一個完整的調查報告，把各個關係人的疑點、證詞與案情的輪廓詳列其中，給將來接辦的人做參考。據指出，這個構想專案小組已向上級建議，原則上應該會獲得同意，只是時間要訂在何時比較合適，目前尚未決定。
這個三方會診的檢討會一旦召開，也就表示尹清楓命案可能將先暫時結案，等待新線索出現，再繼續偵查。如果真演變到這種狀況，尹清楓命案可能就要和陳文成命案、林宅血案一樣，成了台灣社會不能磨滅的傷痛。（摘錄自三六七期【封面故事】，邱銘輝撰文）
尹清楓命案調查報告書
尹清楓最後24小時
一、8日早上到高雄找王琴生。
二、打電話到亞都飯店給涂太太，通知議價書晚上10時給。
三、中午回台北向上司報告自己被設計了。
四、下午與郭力恆、劉富仁、金知文碰面。
五、由郭力恆陪伴去買錄音機，再找張可文、祝本立進行錄音反蒐證。
六、尹、郭分手後，尹去找劉樞，郭去找張鎮瑞。
七、9日凌晨3、4時離開劉樞家回武獲室。
八、9日上午打電話給涂太太要求解釋爽約的機會，然後出發前往亞都。
九、中途折返回海總，與郭力恆約在來來豆漿店碰面。
十、10日上午，尹清楓屍體在宜蘭外海被發現。
誰要來抓尹清楓？
一、王萬瑩：尹清楓說政三、政四要來抓人了。
二、總政戰部鄭重否認。
推測：由於檢舉尹清楓的黑函，曾提及政三人員包庇縱容，因此警方也懷疑會不會有政戰人員私下要脅尹呢？
一通關鍵的神秘電話與黑色手提箱
一、9日上午尹清楓部部屬看見尹在整理手提箱。
二、尹與部屬交談中接了兩通電話，一通是涂太太打來的，一通則是神祕電話。
三、尹出門前往亞都飯店時，交代部屬如果出事要通知其家人。
四、尹遇害後，部屬整理尹房間未發現黑色手提箱，也記不得尹是否有帶出門。
推測：那一通尹清楓一再回答「是」的神祕電話，發話人到目前為止仍查不出來，但從尹的答話情況，專案小組懷疑是尹的某位長官打來的。
為什麼尹清楓沒去亞都，而去了來來豆漿店？
一、9日上午尹清楓出門前往亞都飯店。
二、途中8時10分大哥大響，郭力恆約尹在海總側門見面，後又約在來來豆漿店碰面。
三、8時50分尹到來來豆漿店，尹駕駛邱明星將車開回海總。
推測：尹清楓將涂太太之事當成最重要的兩件任務之一，而就在他要完成任務前，卻被郭力恆改變他的行程，是否郭力恆向尹所提之事的重要性，超過涂太太之事，而這件事是否與尹的清白有關呢？
關鍵時刻上午9時至11時，相關關係人在哪裡？
一、郭力恆從張鎮瑞家前往來來豆漿店，到來來未見尹後回家中。
二、涂太太10時多前往龍江醫院，又去拜訪一位朋友，11時多回到亞都。
三、張濟在公司處理公事，有人證。
四、祝本立參加周宗賢喪禮、拜訪伍世文。
五、劉樞在家打電話。
六、汪傳浦由於年紀甚大，被認為直接涉案成分不大。
推測：如果能證明汪傳浦、郭力恆與張濟都是同一邊的，汪傳浦的行蹤值得再追查。
誰殺了尹清楓？為何殺他？
一、依通聯紀錄顯示郭力恆涉嫌程度不高。
二、張鎮瑞與郭力恆對質後，警方認為張不至於參與謀殺尹清楓。
三、經警方約談後，認為羅綱沒有間題。
四、黑道要角當天都有不在場證明。
五、劉樞不可能知道尹去來來，而也有不在場證明。
六、姚能居雖與尹有過衝突，但沒有證據顯示涉案。
七、金豐鄉的車出現在來來是因去買早點。
八、張濟並非尹反蒐證的對象，而也找不到相關的通話紀錄。
九、傳聞有一眉毛上有痣的軍官將尹帶上車，軍方正在過濾中。
反蒐證錄音行動是殺機嗎？
一、只有郭力恆知道尹在進行反蒐證。
二、兩捲錄音帶，一捲沒什為內容，另一捲則是尹與張可文的對話。
第一現場在哪裡？
一、來來豆漿店附近毫無所獲。
二、各關係人家中也無進展。
三、自強隧道、大直工地、金龍隧道附近都無可疑。
四、各關係人汽車也無異狀。
五、從尹身上採集的砂石，與當時潮流推算，南方澳附近的沙灘可能是棄屍地點。
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