行政院為因應氣候變遷導致的糧食安全挑戰及社會、經濟環境改變，並改善農田水利會會長及會務委員直選後所衍生的地方派系紛爭等情況，達到強化農業水資源利用、擴大對農民服務範圍、強化組織專業經營等政策目標，於106年11月10函送「農田水利會組織通則」部分條文修正草案至立法院審議。
草案規劃將宜蘭等15個農田水利會第4屆會長及會務委員任期至107年5月31日，延長至109年9月30日止，與七星、瑠公2個農田水利會第4屆會長及會務委員任期同，以達全國農田水利會同時改制的目標，不過近日有部份學者連署表達水利會改制應暫緩。
9個水利會發表共同聲明
高雄水利會與全國其他水利會人員，有鑑於目前水資源愈來愈匱乏，管理系統事權不統一，及水利會不具公權力等窘境，導致水資源分配不均，糧食生產無法提升，水質污染嚴重而無公權力取締等糧食安全問題，嚴重損及國民健康及國家農業發展。
因此於今（16）日前往行政院農委會，發表強力支持政府改制農田水利會聯合聲明，參與此共同聲明的水利會包括：宜蘭、石門、新竹、苗栗、彰化，南投、嘉南、高雄及屏東等過半數水利會，以及灌溉面積達全國2/3以上之水利會會長、員工、會務委員、小組長、班長及會員參加，現場有將近來自全國共600多位強力支持政府改制的真正會員及農民代表，過程中由農委會副主委李退之接見致詞。
共同聲明以三個支持及三個同意，內容包括：支持政府改制升格農田水利會，擴大農田灌溉面積，提升國家糧食生產、支持政府賦予水利會公權力，辦理水資源管理和水質安全維護，提升國家糧食安全、支持政府挹注前曕計畫公務預算，降低農田水利灌溉排水溝渠漏水率。
同意行政院農委會保障現有水利會員工工作權益，維持現行職務等級與升遷制度之雙軌並存改制草案、同意行政院農委會將農田水利會資產，仍繼續作農田水利事業使用、專款專用，政府並持續以公務預算投資農田水利建設、同意行政院農委會保留現有工作站與水利小組組織，維持現行運作方式，不因改制升格而消滅。
農委會農田水利處長謝勝信表示，農田水利會改制升格為公務機關的目的，是因應未來氣候變遷與農產品安全的挑戰，使農田水利會能發揮其專業與效能，建構臺灣農業經營環境更佳的基礎建設，以契合新農業政策。
農委會再次強調，本次臨時會的修法，僅延長會長及會務委員任期至109年9月30日止，及規定會長、水利會員工要遵守行政中立，不能偏任何政黨，絕非外界所言有任何政治考量。
農委會未來仍會秉持照顧國人糧食安全、提升國家糧食生產、維護水利會既有員工權益原則下，邀請相關單位及水利會員工研擬一套符合大眾要求的法規、制度及組織，持續為我國農業永續發展做努力。
