有水土不服者。景泰五年 （1454）進士明人徐溥曾記載，某年南京一帶 「春夏以來雨澤少降，南畿荒歉尤甚，疫氣盛行北來人無不沾疾，此亦時事可嘅之一端也 。」嘉靖初年，在〈奏報田州思恩平復疏〉中，王守仁記載 「調集之兵。遠近數萬。屯戍日久。人懷歸思。兼之水土不服。而前歲之疫。死者一二萬人眾情憂惑。自頃以來。疾病死者不可以數。無日無之。潰散逃亡。追捕斬殺，而不能禁。」
有綜合因素交互作用者。在高溫、群聚、衛生糟糕、飲食失節、水土不服等多重因素的作用下，疫情的產生較為常見，如洪武五年（1372）七月，參與中都工程營建的軍士「多以疫死」。明太祖認為是「盛暑重勞，飲食失節，董其役者又督之太急，使病無所養，死無所歸」所致；成化七年（1471）， 翰林檢討張寬之上奏，當時湖廣流民被械歸故里時，由於「適值溽暑，因饑渴而死，妻女被掠，瘟疫盛行，船夫遞解者懼其相染，故覆舟於江」。湖廣流民出現疫情的原因，就在於「官司迫遣上道。時夏月酷熱，民皆聚於舟中，不能宿處，氣相蒸鬱，疫病大作，死者不可勝紀。棄屍水道，塞礙舟楫，哀號之聲動天地」；正德十六年 （1521）六月，明世宗初即位， 因為甯王朱宸濠和錢寧、江彬之獄被拖累的嫌犯數百人關押在監，當時正值「暑雨，疫癘大作」，所以「瘐死者甚眾」。幸虧給事中許復禮、御史陳克宅都上言，要求迅速發落嫌犯。明世宗命司法部門趕緊審錄，得以釋放無辜者二百四十四人。
萬曆十五年（1587）五月，大學士申時行等人上題本，報告當時「天時亢陽，雨澤鮮少，沴氣所感，疫病盛行」的情況；萬曆中期，日本入侵朝鮮。明朝在天津一帶徵兵備禦，由於「宿兵於斥鹵之地，又盛夏癉熱，淫雨日侵，眾無所棲息，疫癘時作，人情大擾 」，明朝才改善軍隊的住宿條件，新建了天津葛沽鎮兵營。邢侗在萬曆中期，曾經擔心明朝軍隊援助朝鮮時，出現 「我兵餉未集，戰期無日，冬春不結必至夏秋。經霖雨之時，居濘潦之地。炎暑蒸其上，瀉鹵侵其下，水土不習，飲食不充癘疫必作，傳染必眾」的情況。
本文部分內容取材自崧燁文化《大明也確診：皇朝的封城日記》
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